中华人民共和国农业行业标准
驴骤马源性成分鉴定 实时荧光定性PCR法
Identification of donkey mule/hinny and horse derived materialsReal-time qualitativePCRmethod
中华人民共和国农业农村部发布
公共服务平台食典通本文件按照GB/T1.1-2020标准化 作作则 第1部分 结构和起草规则》的规定起草.
本文件由农业农村部畜牧兽医局提出.
本文件由全国畜牧业标准化技术委员会(SAC/TC274)归口.
本文件起草单位:山东省农业科学院生物技术研究中心.
本文件主要起草人:张全芳、胡悦、范阳阳、刘艳艳、谭晴晴、杨雪、陈雪燕、刘国霞、陈淑娟、谷玉霞、杨连群、王俊燕、步迅.
驴骤马源性成分鉴定实时荧光定性PCR法
1范围
本文件规定了驴、骤和马3种动物源性成分的实时荧光定性PCR检测方法. 本文件适用于动物肉、皮、毛中驴、骤和马3种动物源性成分的定性检测.
本方法定性检出限为1%.
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中 少的条款 其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于 文件 的规范 必不 包括 新有的修改单)适用于本文件.
GB/T 27403 实验室
3术语和定义
3. 1
实时荧光PCR retin hePCR
在聚合酶链式反 CR进程,对未知模板进行定性或定量分析 的体系中
3.2
循环数阅值cyclehrshl
每个反应管内的荧光信号达到设3.3 c
肌肉肌酸激酶基因 Cea
4原理
为的特异性TaqMan探针,采用实时荧光PCR技术进 根据驴和马的核基因设计马属通用引物,在差异位 信号及 制设计费 满值,判定试样中含有驴、骤和马3种动物源性成分的情况.
5试剂或材料
除非另有规定,仅使用分析纯试剂.
5.1水:GB/T6682.一级水.
5.2Tris-HCl缓冲液(1mol/L.pH 6.4):称取12.10gTris置于100ml.烧杯中,加人80mL水、用盐酸调节pH至6.4.加水定容至100mL,103.4kPa蒸汽压(121“C)灭菌20min,室温保存待用.
5.3Tris-HCl缓冲液(0.5mol/L pH 8.0):称取6.05gTris置于100ml烧杯中 加入80mL水,用盐酸调节pH至8.0.加水定容至100mL.103.4kPa蒸汽压(121C)灭菌20min.室温保存待用.
5.4EDTA缓冲液(0.5mol/L pH 8.0):称取18.61gNaEDTA2HO置于100ml.烧杯中,加人80ml.水,用10%的NaOH溶液,调节pH至8.0,加水定容至100mL 103.4kPa蒸汽压(121C)灭菌
20min,室温保存待用.
5.5十二烷基磺酸钠溶液(SDS.10%):称取10.00gSDS溶解于80mL水中,加水定容至100ml. 103.4kPa蒸汽压(121“C)灭菌20min.室温保存待用.
kPa蒸汽压(121C)灭菌20min,室温保存待用.
5.7细胞裂解液1:取Tris-HCI(0.5 mol/L pH 8.0)缓冲液20ml、EDTA(0.5 mol/ L. pH 8.0)缓冲液5ml、NaCI溶液(5.0mol/L)10ml、10%SDS溶液5ml. 加水定容至100ml.
5.8细胞裂解液Ⅱ:取Tris-HCI(0.5 mol/L pH 8.0)缓冲液40 mL、EDTA(0.5 mol/L.pH 8.0)缓冲液5 mL、NaCI溶液(5. 0 mol/L)10 mlL.、10% SDS 溶液5 mL. 加水定容至 100 ml
5.9蛋白酶K溶液(20mg/mL):称取0.20g蛋白酶冻干品,加水溶解,加水定容至10ml.,分装后于-20C保存.
5.10RNA酶溶液:称取1.00g冻干品RNA酶A溶解于6mL.水中,于100C加热15min,缓慢冷却至 室温,加水定容至10ml.分装成小份存于一20℃.
5.11二硫苏糖醇(DTT.1mol/L):称取1.54gDTT,加入6mL.水溶解,加水定容至10ml..分装后于-20℃保存.
5.12硅珠悬浮液:称取5.00g的硅珠加人20ml.水中充分混合,静置24h,弃掉上清液,然后加人20mL水中充分混合,再静置5h,弃掉上清液.在沉淀的硅珠中加人5ml水,用盐酸调节pH至2.0.
5.13Chclex-100树脂(5%):称取5.00gChclex-100树脂,溶解于水中,加水定容至100ml
5.14DNA结合液:称取60.00g异硫氰酸胍(GUSCN),依次加人Tris-HCI缓冲液(1mol/L.pH6.4)5mL、EDTA缓冲液(0.5mol/L pH 8.0)8mL、TritonX-100溶液(60C)4ml 加水定容至100ml.
5.15漂洗液:称取60.00g异硫氰酸胍(GUSCN),加人Tris-HCl缓冲液(1mol/L.pH6.4)5mL,再加人EITA缓冲液(0.5mol/1. pH8.0)8mL 加水定容至100ml.
5.1670%乙醇:量取70ml无水乙醇,加人30ml水.
5.17TE缓冲液:依次加人Tris-HCI级冲液(0.5 mol/L pH 8.0)1ml. EDTA缓冲液(0.5 mol/1. pH8.0)0.1ml,加水定容至50mL.103.4kPa蒸汽压(121C)灭菌20min,降至室温,4C保存备用.
5.180.5%洗毛剂:取100ml.5%的商品化洗毛剂原液,加水900ml.
5.19实时荧光PCR检测试剂盒试剂:2XTaqManMaster Mix.含有TaqDNA聚合酶(终浓度1U/ 20l),Mg²(终浓度2.0mmol/μL),dNTPs(终浓度0.2mmol/L),驴、和马3种动物源性DNA阳性标准品.
5.20检测用引物和探针:外源质控引物探针序列和驴、骤和马3种动物的通用引物和特异性探针序列见表1.引物探针在序列中的位置见附录A.
表1实时荧光定性PCR引物和探针序列
引物探针名称 缩写 序列(5′-3') 扩增片段 bp外源质控引物-上游 EC-F S'-AGACCACCAAATGOXUCTATC-3' 140外源质控引物-下游 外源质控探针 EC-R EC-PS'CYS-GCGAGGTCCCCTAGAAGAAGAACTCCCTCGC-DAB 3 S'-CGAGATTGAGATCTTCTGCGAC-3通用引物-上游 cbm-F5'-TCATCGTAGCATOGAGGGG-3′ 217通用引物下游 驴源性探针 chm-R5'-AGCAGAGCAGGAAGGGAGTT-3′ Lv-P 5'-JOE-ATAGTTGAAGGTTCTGAAAATTTTTAGGCAAAGOCT-BHQ2 3′马源性探针 M-P5'-FAM-ATAGTTGAAGCTTCTGAAAATTTTTAGGTAAAGCCT-DAB 3”
5.21外源质粒:利用水将人工合成的外源质粒稀释至2×10ng/μl. 外源质粒序列见附录A
6仪器与设备
6.1实时荧光PCR仪:4通道以上(应能检测FAM、JOE和CY5荧光).
6.2紫外分光光度计:波长190nm~900nm.6.3分析天平:感量0.0001g和0.01g. 6.4离心机:最大转速不小于13000g.6.6高压灭菌锅.
6.5振荡型恒温金属浴.
7试验步骤
7.1试样制备
7.1.1肉类试样制备
称取肉类样品约2.00g,用灭菌的生理盐水清洗后,在液氮中充分研磨成粉末.
7.1.2皮类试样制备
盐干皮或释制皮张在平整处边缘取约2.00g,去除毛、脂肪,将试样在水中浸泡20min,用水清洗2次,剪成直径约5mm左右小块,在液氮中充分研磨成粉末.
7.1.3毛类试样制备
称取带毛囊的毛类样品约0.50g,置人0.5%洗毛剂(5.18)中,用超声波清洗干净,再用水冲洗3min~5min,至无泡沫.在无水乙醇中浸泡约5min.室温放置.将样品剪碎,在液氮中充分研磨成粉末,
7.2DNA提取
7.2.1对照样品DNA提取
DNA提取过程中同时设置空白对照、阴性对照和和阳性对照,各对照组成如下:
a)空白对照:水;b)阴性对照:驴、螺和马以外的样品;e)阳性对照:驴、骤和马的等质量混合样品.
7.2.2肉、皮类试样DNA提取
称取约30mg粉末装人2ml.的离心管中,每个样品设立2个平行样,加入400pl.细胞裂解液1(5.7)、10gl.蛋白酶K溶液(5.9)混匀,56C水浴2h,其间不时轻微摇匀.12000g离心5min,吸取上清液转至新的1.5ml离心管中,加人10pl.硅珠悬浮液(5.12)及800pLDNA结合液(5.14),充分混次;8000g离心30s,吸走残余液体,室温放置10min,使残余乙醇完全挥发,加人50gl.TE缓冲液 离心1min,弃上清液.加人700gl.的70%乙醇(5.16)洗涤,8000g离心1min弃上清液,重复此步骤2(5.17)溶解DNA,加人1pl.RNA酶溶液(5.10),37C水浴5min,8000g离心1min,吸取上清液转移至新的离心管中,一20C保存备用.
注:提取DNA也可采用经验证等效的动物组织DNA提取试剂盒,按照试制盒使用说明书提取.
7.2.3毛类试样DNA提取
称取10mg~50mg毛类试样粉末至2mL离心管中,每个样平行提取2管,加人400gl.细胞裂解液Ⅱ(5.8)、10pl蛋白酶K溶液(5.9)、10gL.二硫苏糖醇(DTT.1mol/L)(5.11),混匀,放至振荡型恒温金属浴中,56C800r/min裂解3h~5h,直至毛发完全裂解.加100gl.Chelex-100树脂(5%)(5.13),煮沸8min,8000g离心3min取上清液至新的1.5mL离心管中.加入硅珠悬浮液(5.12)10pl. 加 800gLDNA结合液(5.14),充分混匀,室温静置5min,8 000g离心1min:加人700l.漂洗液(5.15),涡旋振荡悬浮,8000g离心1min.弃上清液;加人700gl.70%乙醇(5.16)洗涤,8000g离心1min弃上清液,重复此步骤2次;8000g离心30s,吸走残余液体,室温放置10min,使残余乙醇完全挥发,加入50 glL TE缓冲液(5.17)溶解DNA.加人1 lL.RNA酶溶液(5.10),37C水浴5min,8 000g 离心1 min,吸取上清液转移至新的离心管中,一20C保存备用.
注:提取DNA也可采用经验证等效的动物组织DNA提取试剂盒,按照试剂盒使用说明书提取.