中华人民共和国国家标准
GB/T30988-2014
Methods of genomic DNA extraction from plants with high levels of polyphenols
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
目 次
前言1范围3缩略语 2规范性引用文件4原理5实验室通用要求6试剂与溶液7仪器和设备8提取步骤9DNA纯度、浓度测试
前言
本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草.本标准由中国测试技术研究院提出. 本标准由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)归口.本标准起草单位:中国测试技术研究院、中测测试科技有限公司.本标准主要起草人:谭和平、沈兴中、唐祥凯、周李华、孙登峰.
多酚类植物基因组DNA提取纯化 及测试方法
1范围
方法, 本标准规定了以茶树为代表的多酚类植物基因组DNA提取纯化方法以及DNA纯度、浓度测试
本标准适用于茶树、马铃薯、樱桃、葡萄以及其他富含多酚类的植物的植物基因组DNA提取及纯化.
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T6682-2008分析实验室用水规格和实验方法
GB/T19495.3-2004转基因产品检测核酸提取纯化方法
Tris:三(羟甲基)氨基甲烷 下列缩略语适用于本文件.SDS:十二烷基磺酸钠PVP:聚乙烯毗咯烷酮RNase A:核糖核酸酶AFF:二甲苯青 EDTA:乙二胺四乙酸TE:三(羟甲基)氨基甲烷-乙二胺四乙酸
4原理
4.1提取纯化
化褐变,同时利用聚乙烯毗略烷酮(PVP)的粘接性去除多酚类化合物及其他次生代谢物等杂质,然后利 在液氮条件中,通过物理研磨方法破碎多酚类植物叶片的细胞,利用抗氧化剂防止多酚类化合物氧用化学方法使DNA从植物细胞中释放出来,再弃除DNA中的蛋白质等杂质,以及DNA提取过程中加人的异戊醇、异丙醇、乙醇等有机溶剂,最后得到纯的DNA.
4.2纯度测试
在pH 7~8.5下,根据DNA在260nm处有吸收高峰,蛋白质在280nm处有吸收高峰,硫氰酸盐、碳水化合物(糖类)在230nm处有吸收高峰,酚类物质在270nm处有吸收高峰的特性,利用A:c/A、
A/A、A/A的比值来评估DNA样品的纯度,然后利用A=1相当于50μg/mL的双链DNA来计算DNA的浓度.
过观察DNA条带是否单一、清晰、明亮来评估DNA样品的纯度. 利用荧光染料(如溴化乙啶)可与琼脂糖凝胶中的DNA嵌合,在紫外源激发下发出荧光的特性,通
5实验室通用要求
按照GB/T19495.3-2004第4章中实验室通用要求的规定执行.
6试剂与溶液
6.1本标准所使用的水均为一级水,符合GB/T6682一2008的要求.除非另有说明,在分析中仅使用0.22um膜过滤除菌:酶溶液应避免反复冻融. 分析纯试剂,试剂溶液宜大体积配制、小体积分装后经高压灭菌后使用,不宜高压灭菌的试剂应用6.2葡萄糖(glucose,CH;O).6.3焦亚硫酸钠(sodium pyrosulfite,NaSO)6.4聚乙烯吡咯烷酮[polyvinylpyrrolidone,PVP,(CH NO).]. 6.5β-硫基乙醇(β-mercaptoethanol HOCH CHSH).6.6十二烷基磺酸钠(sodium dodecyl sulfate SDS,CH:O SN).6.7乙胺四乙酸钠(ethylenediaminetetraacetic acid disodium saltNa;EDTAC H NO Na).6.8三(羟甲基)氨基甲烷[tris (hydroxymethyl)methyl aminomethane Tris C HNO].6.9无水乙醇(alcohol CH;OH),4C保存及使用. 6.10氯化钠(sodiumchloride,NaCl).6.11三氯甲烷(chloroform,CHCl).6.12异丙醇[isopropyl alcohol,CH CH(OH)CH,].6.14乙酸钠(sodium acetate,NaAc)溶液:3mol/L,用乙酸调pH至5.2,不要高压灭菌(0.22μm膜过 6.13异戊醇[isoamyl alcohol (CH);CHCHCHOH].滤).6.15氯仿:异戊醇乙醇溶液(80:4:16)6.16 DNA 提取液 I :100 mmol/L Tris-Cl 20 mmol/L EDTA 500 mmol/L NaCI 1.5% SDS.6.17DNA 提取液Ⅱ:18.6 g葡萄糖,6.9 gNaS:O,6.0g PVP 240μL β-硫基乙醇,加水至300 mL. 6.18TE 缓冲液(pH 8.0):10 mmol/L Tris-Cl 1 mmol/L EDTA 使用 HCI或 NaOH 调节 pH.6.19RNaseA酶溶液:10mg/mL,-20C保存,避免反复冻融.6.2070%乙醇溶液:4℃保存及使用.6.2110×上样缓冲液:含0.25%澳酚蓝,0.25%二甲苯青FF,30%甘油水溶液.
7仪器和设备
7.1冷冻研磨机(样品冷冻,研磨都处于液氮条件下).7.2离心机(可以在4℃下进行离心,离心转速10000r/min以上).7.3水浴锅(工作范围60℃~70℃) 7.4涡旋器.7.5平板电泳仪.2