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GB/T 34777-2017 中国仓鼠卵巢(CHO)细胞表达产品残留DNA检测 荧光定量PCR法.pdf

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中华人民共和国国家标准

GB/T 34777-2017

中国仓鼠卵巢(CHO)细胞表达产品 残留DNA检测荧光定量PCR法

Detection of residual DNA in biological product which expressed fromChinese hamster ovary(CHO)cell-Fluorescent quantitative polymerase chain reaction assay

中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布

前言

本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.本标准由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口本标准起草单位:信达生物制药(苏州)有限公司、中国测试技术研究院生物研究所.本标准主要起草人:孙左宇、周李华、李雪峰、黄晓刚、袁志军、郭燕红.

中国仓鼠卵巢(CHO)细胞表达产品 残留DNA检测荧光定量PCR法

1范围

本标准规定了检测残留宿主DNA的荧光定量PCR法.本标准适用于CHO(中国仓鼠卵巢细胞)宿主细胞系表达的生物制品的残留宿主DNA的检测.

2规范性引用文件

件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件. 下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件.

3.1

Ct 值cycle threshold

每个反应管内荧光信号达到设定阔值时所经历的循环数.

4缩略语

下列缩略语适用于本文件.

CHO:中国仓鼠卵巢(Chinese Hamster Ovary)

5原理

物,包括正向引物:Forward Primer(5′-CCAGGCATTGGTGGCAC-3’>和反向引物:Reverse Primer (5'AGACAGGGTTTCTCTGT-3′).

采用SYBR荧光定量PCR(FQ-PCR)法,采集荧光绘制出的PCR扩增曲线C1值,与扩增体系中起始目的基因模板的对数值呈反比,以起始模板DNA对数值为纵坐标,Ct值为横坐标,制作标准曲线.

6仪器设备

6.1荧光定量PCR仅:含有SYBR荧光染料检测通道.6.2紫外-可见分光光度计:波长范围:200nm~760nm. 6.3微型离心机:转速范围:2000r/min~23000r/min

GB/T 34777-2017

6.4电热恒温水浴锅:室温至100C:温度波动范围:±0.5C:温度显示精度:0.1℃,6.5生物安全柜/超净工作台.

7试剂或材料

除非另有说明,本方法中仅使用分析纯试剂,水为GB/T6682规定的一级水.试剂盒的组成与相

关试剂的配制方式参见相应的厂家说明书.7.1基因组提取试剂盒.7.3DNA提取试剂盒. 7.2基因组纯化试剂盒.7.4引物:PCRE向引物;Forward Primer(5′-CCAGGCATTGGTGGCAC-3合成 PAGE级);PCR反向引物:Reverse Primer(5'-AGACAGGGTTTCTCTGT-3合成PAGE级).7.5限制性内切酶:EcoRI.7.6DNA 标准品. 7.7染料法荧光定量试剂盒.7.8蛋白酶 K(Proteinase K).7.9异丙醇(AR).7.10无水乙醇(AR).

8试验步骤

8.1DNA提取

8.1.1待测样品残留DNA的提取制备

用超纯水将待测样品稀释至蛋白浓度为1mg/mL~20mg/mL,取100μL稀释后的样品,参照DNA提取试剂盒的说明书,进行残留DNA的提取.

8.1.2阳性对照样品DNA的提取制备

用超纯水将待测样品稀释至蛋白浓度为1mg/mL~20mg/mL,取100pL稀释后的样品,加入20μL100pg/mL的DNA标准品,参照 DNA提取试剂盒的说明书,进行残留DNA的提取.

8.1.3阴性对照样品DNA的提取制备

用待测样品所对应的制剂缓冲液作为样品,参照8.1.1的方法进行相同倍数的稀释后,取100μL稀释后的样品,参照DNA提取试剂盒的说明书,进行残留DNA的提取.

8.2PCR扩增检测

8.2.1DNA标准品工作液的制备

0.1pg/mL等系列浓度,用于标准曲线的制备. 取 DNA 标准品 分别稀释至 100 ng/mL、10 ng/mL 、1 ng/mL、100 pg/mL10 pg/mL、1 pg/mL和

8.2.2Real-time PCR条件及体系

按表1进行反应体系的配制,各样品制备3个复孔,加样过程先将除DNA模板(即供测试的样品)以外的各组分额混合,16pL/孔,最后加人标准品/待测样品/阴性对照/阳性对照DNA9μL/孔,加好 2

后盖紧盖子,将PCR96孔板或8联管于台式离心机中瞬时离心,使混合液集中于底部.放人PCR仪的抽屉.

表1PCR扩增体系

体系组分 样品量 12 p1.Premix Ex(2×) PCR E向 引物;PCR Forward Primer(F 10 μmol/1) 1 xLPCR反向引|物:PCR Reverse Primer(R' 10 xmol/L) 1 xL超纯水(不含核糖核酸) 1 6 μLROX 参比荧光染料;R(OX Reference Dye(50×} 0 4 μxlDNA 模板(即供测试的样品) 对于不同试剂盒其扩增效率可能会有较大差异,在检测时应先确保系统适应性符合8.2.4.2的要求,必要时可调 9 yL整PCR扩增体系的样品量

8.2.3扩增条件

将制备好的PCR反应体系放人PCR仅的抽屉,按表2的反应条件进行PCR扩增.

表2PCR扩增条件

预变性 步骤1 变性 步骤2(40个循环) 退火 延伸 变性 溶解 步骤3 变性 溶解S6 95 52′℃ 72 95 ′℃ 60 ° 95 60℃30 s 1 min 1 min 1 min 15 s 1 min 30 s 15 s

8.2.4系统适应性要求

8.2.4.1有效扩增孔的取舍:根据如下检测数值的取舍标准选择有效孔:a)标准曲线上各数据点复孔,可根据标准曲线线性关系的好坏来判断是否舍去,可舍去明显影响 标准曲线相关性(使R≥0.99)的复孔数据,整条曲线上含去的复孔数不得超过3个:b)阳性对照、待测样品各复孔间检测的Ct值的SD值大于0.5时,且由此计算的DNA残留值在定量限以上,则该数据应重新检测.8.2.4.2系统适用性要求: a)扩增效率应在90%~110%;b)标准曲线的相关系数R≥0.99:c) 阳性对照样品中DNA标准品的加样回收率应在50%~150%;d)阴性对照孔无非特异性扩增(DNA含量应小于或等于1pg/mL).

8.3结果计算

8.3.1-般原则

阳性对照中DNA标准品的加样回收率为实际检测到在阳性对照中添加的DNA标准品的量,除以在阳性对照中添加的DNA标准品的理论值.阳性对照中检测到的DNA总量减去待测样品中检测得到的DNA量即为实际检测到添加的DNA标准品的量.由于各样品中提取的DNA体积固定,在计算 过程中直接用浓度表示.

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