NY
中华人民共和国农业行业标准
NY/T 4908-2025
芝麻品种鉴定 SSR分子标记法
Identification of sesame varieties-SSRmarker method
中华人民共和国农业农村部 了发布
目 決次
前言2规范性引用文件 1范围.3术语和定义4缩略语原理..6主要仪器设备及试剂. 7溶液配制8引物信息及使用参照品种及使用10操作程序,11结果判定与表述 附录A(规范性) 主要仪器设备及试剂附录B(规范性) 溶液配制附录C(规范性) 引物名单及序列附录D(资料性) 引物相关信息附录F(资料性)引物分组 附录E(资料性) 参照品种相关信息
前言
本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由农业农村部种业管理司提出.
本文件由全国植物新品种测试标准化技术委员会(SAC/TC277)归口.
本文件起草单位:江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所、农业农村部科技发展中心、河南省农业科学院.
本文件主要起草人:王显生、孙建军、韩瑞玺、于整、豆丹丹、邓伟、张凯渐、沈奇、王红红、王艳平、张秀杰、郭玉玺、李华勇、汪鸿星、刘晓宏、潘红.
芝麻品种鉴定SSR分子标记法
1范围
义、缩略语、原理、主要仪器设备及试剂、溶液配制、引物信息及使用、参照品种及使用、操作程序、结果判定 本文件规定了利用简单重复序列(SSR)标记进行芝麻(SesamumindicumL.)品种鉴定的术语和定与表述.
本文件适用于芝麻品种的SSR指纹数据采集和品种鉴定.
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用面构成本文件必不可少的条款,其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法 GB/T3543.2农作物种子检验规程第2部分:扦样NY/T2594植物品种鉴定DNA分子标记法总则
3术语和定义
NY/T2594界定的术语和定义适用于本文件.
4缩略语
APS:过硫酸铵(ammonium persulphate). 下列缩略语适用于本文件.bp:碱基对(base pair).CTAB:十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrimethylammonium bromide).dNTPs:脱氧核糖核甘三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphates). DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonueleic acid).EDTA:乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetie acid) PAGE:聚丙烯酰胺减胶电泳(polyacrylamide gelelectrophoresis).PCR:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction).SSR:简单重复序列(simple sequence repeat). Tag 酶:耐热 DNA 聚合酶(Taq-DNA polymerase).TBE:三羟甲基氨基甲烷-硼酸盐-乙二胺四乙酸(Tris-borate-EDTA).TE:三羟甲基氨基甲烷-乙二胺四乙酸(Tris-EDTA).TEMED四甲基乙二胺(N N N' N‘tetramethylethylenediamine). Tris:三羟甲基氨基甲烷[Tris(hydroxymethyl)methyl aminomethane THAM].
5原理
芝麻基因组存在着大量能够稳定遗传的SSR位点,不同芝麻品种在同一SSR位点的重复次数可能存在差异,这种差异可通过利用DNA提取、PCR扩增及电泳等方法进行检测,进而通过一组SSR引物组 合区分不同的芝麻品种.
6主要仪器设备及试剂
主要仪器设备及试剂应符合附录A的要求.