前言
SN/T4849(出口食品及饮料中常见小浆果成分的检测方法实时荧光PCR法》系列标准共分为6部分:
第1部分:蓝莓: 第2部分:树莓:第3部分:黑加仑:第4部分:桑甚:第5部分:蔓越莓和蓝莓:第6部分:称猴桃.
本部分为SN/T4849的第4部分.
出口食品及饮料中常见小浆果成分的 检测方法实时荧光PCR法 第4部分:桑葚
1范围
SN/T4849的本部分规定了出口
品及饮料中桑甚成分的定性检测(清汁及果酒除外).本部分所规定方法的最低检出限(LOD)为1% 本部分适用于鲜果、冷冻果、蜜饿 鲜榨果汁,果肉型果汁、果干、果酱等以桑葚为原辅料的初加工食(体积比).
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB/T27403-2008实验室质量控制规范食品分子生物学检测
3术语和定义、缩略语
3.1术语和定义
下列术语和定义适用于本文件3.1.1
小浆果small berry fruits
浆果是指由一个子房或联合其他花器发育成的柔软多计的肉质单果,由一个或几个心皮形成.小浆果则泛指果实较小、多汁的一类浆果.3.1.2
桑喜mulberry
尊麻目桑科桑属植物果实,为聚花果,由多数卵圆形小核果集合而成,呈长圆形,黄棕色、棕红色至暗紫色,(部分品种成熟后呈乳白色).拉丁文名:MorusalbaL.
3.2缩略语
下列缩略语适用于本文件.
PCR:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction) DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonuleicacid)Ct值:每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数dNTP:脱氧核苷酸三磷酸(deoxyribonuleoside triphosphate)dATP:脱氧腺苷三磷酸(deoxyadenosine triphosphate)dCTP:脱氧胞苷三磷酸(deoxycytidine triphosphate)
SN/T 4849.4-2017
dGTP:脱氧乌苷三磷酸(deoxyguanosine triphosphate)dTTP:脱氧胸苷三磷酸(deoxythymidine triphosphate)UNG:尿喀啶N-糖基化酶(uracilN-glycosylase)Tris:三羟甲基氨基甲烷[Tris(Hydroxymethyl)aminomethane] CTAB:十六烷基三甲基澳化铵(cetyltrithylammoniumbromide)EDTA:乙二胺四乙酸(Ethylene diaminetetraacetic acid)Taq:水生栖热菌(Thermus aquaticus)OD:光度密度(optical density)
4方法提要
果实样品直接粉碎离心,果汁样品直接离心,提取沉淀DNA,果干、果酱、蜜饯先用蒸馏水清洗再提取DNA.以桑套果实为阳性对照,以其他水果DNA为阴性对照,无菌水作为空白对照.使用特异性引物探针进行实时荧光PCR扩增,通过实时荧光信号曲线判定是否存在桑甚成分.
5试剂和材料
除另有规定外,试剂均为分析纯或生化试剂.实验用水符合GB/T6682的要求.试剂均用无DNA酶污染的容器分装.
5.1检测用引物和探针:桑套成分扩增引物和探针、内参照(显花植物NADH基因)引物和探针详见表1.桑套引物扩增的靶标序列参见附录A.
表1桑葚序列引物探针
物种名称 引物/探针序列(5→3’) 扩增片 杷基因段长度内参照 R;AGGAGCCGTGTGAGATGAAAGTCTCA F:GCTGAAGCAGCTACTTTCGAAGTAACA 138 bp NADH dehydrogenaseP;FAM-TGGAGTGGGAGAGTCAGAGTCGAAAAGAGG-BHQ1 subunit B(mdhB)geneF;TGCGCCCTCAGCATAAAA桑甚 R;GAGCTCGTTTCGTTATGATTCCT 65 bp 28S ribosomal RNAP:FAM-CCAGGCGCGGAACGCGTC-BHQ1 (28S rRNA)gene
5.2三氯甲烷(氯仿).5.3异丙醇.5.4CTAB 提取缓冲液:20 g/L CTAB,1.4 mol/L NaCl 0.1 mol/L Tris-HCl 0.02 mol/L NaEDTA,pH 8.0.5.670%乙醇(体积分数). 5.5CTAB沉淀液:5g/LCTAB 40mmol/LNaCl.5.7蛋白酶K(20mg/mL).5.8实时荧光PCR反应混合液:12.5μL反应体系包括:1U~2U(Unit,酶学单位)的Taq酶、1×PCR buffer、2.5 mmol/L~4.0mmol/L的 Mg²、0.2 U~1 U 的 UNG 酶、0.2mmol/L的 d(A,C G)
TPs、0.2mmol/L~0.4mmol/LdUTP、400nmol/LROX染料.
5.910×PCR缓冲液:200mmol/LTris-HCl(pH8.4).200mmol/LKCl 15mmol/LMgCl
6仪器设备
6.1实时荧光PCR仪. 6.2核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计.6.3恒温水浴锅.6.4离心机:最大离心力不小于12000g.6.5微量移液器:0.5μL~10μL 10μL~100μL.20pL~200μxlL.200μL~1 000μl.6.6粉碎装置. 6.7涡旋震荡器.6.8pH计.6.9量筒:容量50ml.6.10烘箱.
7检测步骤
7.1样品前处理
鲜果、冷冻果样品直接粉碎,6000r/min离心,取沉淀物部分.果干、果酱、蜜饯类样品先用蒸馏水清洗3次,再粉碎.
果汁样品取适量15000r/min离心30min,取沉淀部分.
7.2DNA提取
取粉碎后的样品50mg~200mg,加人1mL裂解液,同时加人0.01倍体积的20mg/mL蛋白酶K,65C温育1h~2h,期间不时震荡混匀,应保证样品自由悬浮于液体中,必要时再加人适量CTAB提取缓冲液:取出后12000r/min离心10min,转移上清至2mL离心管中,加人0.7倍体积的三氯甲烷,剧烈震荡混匀,12000r/min转速下离心10min;转移上清至另一灭菌的离心管中,再加入0.7倍体积的 三氧甲烷,剧烈震荡混匀,室温下12000r/min离心10min;转移上清至干净离心管中,加人等体积的CTAB沉淀液混匀,室温沉淀1h;13000r/min的转速离心10min;弃上清,加人350pL1.2mol/LNaCI溶液,充分溶解沉淀;加人0.8倍体积的异丙醇或2倍体积一20C冰箱中预冷的无水乙醇混匀,-20℃放置30min,12000r/min4℃离心10min,弃上清,用70%乙醇洗涤沉淀一次,12000g4℃离心10min,弃上清,室温下晾干.加人50μL~100pL双蒸水,室温10min,混匀,-20C保存.
上述模板DNA均可用等效DNA提取试剂盒提取.
7.3DNA浓度和纯度的测定
使用核酸蛋白分析仅或紫外分光光度计分别检测260nm和280nm处的吸光值A和A.DNA的浓度按照式(1)计算:
式中:
c-DNA浓度,单位为微克每微升(μg/μL);
A-260nm处的吸光值;
N--核酸稀释倍数.