中华人民共和国国家标准
GB/T46927-2025
时空组学 数据集格式规范
Spatio-temporal omics-Specification for dataset format
国家市场监督管理总局 国家标准化管理委员会 发布
目次
前言1范围2规范性引用文件3术语和定义4缩略语5时空组学元数据要求6时空组学数据集文件要求6.1通则 6.2高通量测序数据6.3显微图像6.4时空芯片基因表达矩阵数据6.5时空芯片基因表达热图数据6.6时空组学图像处理参数文件6.7已配准图像金字塔数据7时空组学数据存储目录要求7.1总则 .......7.2目录结构说明7.3编码规则附录A(资料性)时空组学元数据A.1 概述. A.2字段必选性说明A.3时空组学数据集元数据表A.4时空组学生物信息分析环境元数据表 11A.5元数据提供方式 12附录B(资料性)时空芯片基因表达矩阵数据概述. 13B.2 数据结构 13B.3示例.....B.4约束与解析规则 15附录C(资料性)时空芯片基因表达热图数据 16C.1概述.. 16附录D(资料性)时空组学图像处理参数文件 C.2时空芯片基因表达热图数据的文件结构2
D.2时空组学图像处理参数文件的数据结构 D.1概述 24附录E(资料性)已配准图像金字塔数据 26E.1述 26E.2已配准图像金字塔数据文件结构详解 26参考文献
前言
本文件按照GB/T1.1一2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
请注意本文件的某些内容可能涉及专利:本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口.
本文件起草单位:深圳华大生命科学研究院、中国测试技术研究院、武汉华大生命科学研究院、之江实验室、西南华大生命科学研究院、深圳赛陆医疗科技有限公司、深圳大学、菁良科技(深圳)有限公司、鹏城实验室、北京诺禾致源科技股份有限公司、苏州百源基因技术有限公司、利德健康科技(广州)有限公司.
本文件主要起草人:陈毓新、周李华、张楠、王乐颖、张勇、李胜康、冯琳清、杜玥、谢敏、徐讯、黎宇翔、徐枣旭、吴边、朱泽轩、林木飞、李菁华、宝力格、王荣杰、车团结、张峰、车妍.