中华人民共和国国家标准
GB/T21102-2007
Identification of rabbit derived materials in animal-originated feedstuffsReal time PCRmethod
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
前言
本标准由中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局提出.
本标准由全国饲料工业标准化技术委员会归口.
本标准主要起草单位:中华人民共和国辽宁出人境检验检疫局、宝生物工程(大连)有限公司、中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国山东出入境检验检疫局、中华人民共和国深圳出人境检验检疫局、中华人民共和国上海出人境检验检疫局.
宗卉、金东权. 本标准主要起草人:郑秋月、李品泉、王玉萍、徐昊、曹际娟、于爱画、张舒亚、陈颖、徐宝梁、高宏伟、
本标准首次发布.
动物源性饲料中免源性成分定性 检测方法实时荧光PCR方法
1范围
本标准规定了动物源性饲料中免源性成分实时荧光PCR检测方法,该检测方法的检出限为0. 1%.
本标准适用于动物源性饲料中免源性成分的定性检测.
2规范性引用文件
下列文件中的条款通过本标准的引用面成为本标准的条款.凡是注日期的引用文件,其随后的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本标准,然面,鼓励根据本标准达成协议的各方研究 是否可使用这些文件的最新版本.凡是不注日期的引用文件,其最新版本适用于本标准.
GB6682分析实验室用水规格和试验方法GB/T 14699.1饲料采样(GB/T14699.1-2005,ISO6497:2002.IDT)
SN/T1193基因检验实验室技术要求
3术语和定义
下列术语和定义适用于本标准.
实时荧光PCRreal timePCR
实时荧光聚合酶链式反应.
3.2
Ct值cyele time
每个反应管内的荧光信号达到设定的闽值时所经历的循环数.
4原理
采用TaqMan实时荧光PCR技术,根据线粒体DNA的细胞色素C氧化酶亚单位I(cytochrome C胞,三氯甲烷抽提蛋白质,异丙醇沉淀得到DNA:以提取的DNA为模板进行实时荧光PCR扩增.本 oxidasesubunitI,COX1)基因上动物种间多态性的差异而进行兔源性成分鉴定.利用裂解液破碎细标准应用多色荧光检测技术,采用多重PCR方法,将所用试剂配制成预混合形式,组建成实时荧光PCR兔DNA检测试剂盒.对反应液中含有的两种不同荧光染料进行双通道同步检测,在同一反应管内对免的COX1基因及内参照基因同时进行扩增,并通过标记两种不同荧光物质6-骏基荧光素(6-car-boxyfluorescein,FAM)、5-六氯荧光素(5-hexachloro-fluorescein,HEX)的探针进行特异性杂交,两色荧 光同步检测.其中,对内参照反应的检测,可以监控反应是否正常进行,防止假阴性结果.观察实时荧光PCR的增幅曲线,从而对饲料中免源性成分进行快速检测.
5试剂与材料
除另有规定外,试剂为分析纯或生化试剂,实验用水符合GB6682的要求.
5.1DNA提取用试剂
5.1.1三氯甲烷.
GB/T 21102-2007
5.1.5裂解液:1%CTAB(cetyltrithylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),0.05mol/LTris-HC1(pH 8 0)[Tris :tris(hydroxymethyl)aminomethane三(羟甲基)氨基甲烷],0.7mol/LNaCl 0 01 mol/L EDTA (pH8. 0)(ethylene diaminetetraactic acid 乙二胺四乙酸)
5. 1.6TE 缓冲液(Tris-HCI、EDTA 缓冲液): 10 mmol/L Tris-HCI(pH8. 0) 1 mmol/L EDTA(pH8 0).
5.2实时荧光PCR免DNA检测试剂盒
5.2.12×兔源性检测预混合液:含有ExTaq HS(终浓度1.25U/25pL)、dNTPs(终浓度各0.4mmol/L)Mg²(终浓度3 mmol/L)
5.2.2免源性检测引物混合液:含有扩增免基因组DNA及内参照的引物(序列详见表1)、内参照(A DNA).各引物终浓度0. 1 pmol/L~1. 0rmol/L
表1免及内参照引物序列
名称 序列兔5-引物 兔3-引物 5′-TAATCGTCACCGCACATGCC-3′5′-CTATGTCAGGAGCCCCAATTATCA-3′内参照5'-引物 5′-GGCTGATTGACCGGCAGATTA-3′- 5′-GCGGGTATAGGTTTTATTGATGGC-3
5.2.3免源性检测探针混合液:检测免基因组DNA的探针及检测内参照的探针(序列详见表2).探针浓度与使用的实时荧光PCR扩增仪、荧光标记物质种类有关,实际使用时请参照仪器说明书,或各荧光探针的具体使用要求进行.
表2免及内参照探针序列
名称 序列兔探针 5′(FAM)-ACAAGCCAGTTCCCGAAGCCTCCA -3′(Eclipse)内参照探针 5′(HEX)-CCGCCACGACGATGAACAGACGCT 3’(Eelipse)
5.2.4阳性对照:用已知含哺乳动物源性成分的样品作阳性对照.
5.2.5双蒸水,
6仪器设备
6.1实时荧光PCR检测系统.6.3电子天平:感量0.01g. 6.2核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计.6.4离心机:离心力12000g.0~00~0-00~96.6实时荧光PCR反应管.6.7恒温水浴箱.
7试样选取与制备
按照GB/T14699.1采样,将实验室样品粉碎,充分混合均匀后待用.
8检验步骤
8.1样品的总DNA提取
心管中,加人600 L~800 μL裂解液,65C 30min,每隔10min 振荡混匀:12000r/min离心5 min,吸取上清液至一新离心管中.加400yL三氯甲烷异戊醇(241),充分混匀:12000r/min离心5min,吸取上清液至一新离心管中,加0.8倍体积异丙醇,室温下沉淀1h~2h:12000r/min离心10min,弃上清液;70%乙醇洗涤一次,晾干:加人50LTE,溶解沉淀.
也可用等效的DNA提取试剂盒提取模板DNA.
8.2DNA浓度和纯度的测定
取5gLDNA溶液加双蒸水稀释至1mL,使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计测260nm和280nm处的吸光值A和As.DNA的浓度按式(1)计算:
式中:
--DNA浓度,单位为微克每微升(μg/pL);A260nm处的吸光值;
N核酸稀释倍数.
当A/A比值在1.7~1.9之间时,适宜于PCR扩增.
8.3实时荧光PCR检测
8.3.2在各实时荧光PCR反应管中加入上述试剂后,盖紧管,离心5s~10s. 性检测探针混合液各加 1 plL,样品 DNA(1 ng/μL~100ng/μL)1L 加双蒸水至25pl.8.3.3将离心后的实时荧光PCR反应管放入实时荧光PCR检测系统内,记录样本摆放顺序.8.3.4实时荧光PCR反应参数可根据基因扩增仪型号的不同进行适当的调整,一般的反应程序为:95T10s,1个循环;95C5s 60C30s.40个循环,在每次循环的退火时收集荧光.8.3.5检测结束后,根据扩增曲线和Ct值判定结果.8.3.6检测过程中分别设阳性对照、阴性对照和空白对照.用已知含免源性成分的样品作阳性对照, 用已知不含兔源性成分的样品作阴性对照,用等体积的双蒸水代替模板DNA作空白对照.
注:也可用等效的兔源性成分实时荧光PCR检测试剂盒进行实时荧光PCR检测.
9结果判断与表述
9.1结果分析条件设定
直接读取检测结果.阀值设定原则根据仪器噪声情况进行调整.
9.2结果判定
9.2.1对照结果
空白对照:无FAM荧光信号检出.有HEX荧光信号检出,C1值应<35.0.阴性对照:无FAM荧光信号检出.有HEX荧光信号检出,C1值应<35.0.阳性对照:有FAM和HEX荧光信号检出.且FAM通道出现典型的扩增曲线,Ct值35为无效值(详见表3).