中华人民共和国国家标准
GB/T28073-2011
Detection and identification of arabis mosaic virus
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
前言
本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草.
本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口
本标准起草单位:中华人民共和国厦门出人境检验检疫局、中华人民共和国上海出人境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国福建出人境检验检疫局.
本标准主要起草人:廖富荣、于翠、张永江、陈红运、林石明、陈青、黄蓬英、沈建国、吴媛.
南芥菜花叶病毒检疫鉴定方法
1范围
本标准规定了南芥菜花叶病毒血清学和分子生物学的检测鉴定方法.本标准适用于植物种子、鳞球茎、苗木和组培苗等植物及其产品中南芥菜花叶病毒的检测与鉴定.
2南芥菜花叶病毒基本信息
中文名:南芥菜花叶病毒.
英文名:arabis mosaic virus.
异名:arabis mosaic nepovirus;hop netlehead virus(啤酒花尊麻病病毒);rhubarb mosaic virus(大黄花叶病毒);raspberry yellow dwarf virus(悬钩子黄矮病毒);ash ring and line pattern viurs(白腊树环线状病毒);rhabarber-mosaik-virus(大黄花叶病毒):forsythia yellownetvirus(连翘黄网状病毒);jasmine yellow blotch virus(茉莉黄斑病毒).
英文缩写:ArMV.
属虹豆花叶病毒科Comoviridae,线虫传多面体病毒属Neporviras.
南芥菜花叶病毒的其他信息参见附录A.
3方法原理
利用基于抗原抗体反应的双抗夹心酶联免疫吸附测定(DAS-ELISA)、反转录和体外DNA扩增技术的反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行检测鉴定.
4主要仪器设备
本标准的检测鉴定方法主要使用以下仅器设备:
微量榨汁机、酶标仪、洗板机、微量天平(感量:0.001g)、PCR仪、荧光PCR仪、电泳仪、水平电泳槽、凝胶成像仪、高速冷冻台式离心机、水浴槽、pH计等和各种量程的可调移液器(1000pL、200pl、100 μl. 20 μl 10μL 2 pl)
5检测与鉴定
5.1DAS-ELISA 检测
把0.5g~1.0g样品充分研磨或在液氮中研磨,按1110比例加人样品提取缓冲液,转移到5mL离心管中,8000r/min离心5min,上清液作为DAS-ELISA的检测提取液.
样品类型相一致,具体操作过程见附录B. 设置阴性对照、阳性对照和空白对照,阴性对照的种类和材料(如:种子或叶片)应该尽量与所检测
注:提取液在3h内使用,否期保存在4C中.
5.2RT-PCR检测
ArMV的植物组织作阳性对照,用超纯水作空白对照. 分别提取检测样品的总RNA,然后用RT-PCR检测.用健康的植物组织作阴性对照,用感染
具体操作过程见附录C.
5.3实时荧光RT-PCR检测
阴性对照,用感染ArMV的植物组织作阳性对照,用超纯水作空白对照. 分别提取检测样品的总RNA,反转录合成cDNA后用实时荧光PCR检测.用健康的植物组织作
具体操作过程见附录D.
5.4序列测定
将PCR产物回收后,进行克隆、测序,或者直接测序,测序可由生物公司完成.把测序所得到的核性大于75%则判定为ArMV序列,小于75%则判定为非ArMV序列.
注:序列比对可利用 NCBI 网站上的 BLAST 款件进行 网址为 htp:/ ncbi nlm. nih. gov/BLAST/
6结果判定与报告
6.1结果判定
当产生以下检测结果时,则判定为检出ArMV:当DAS-ELISA检测、RT-PCR检测、实时荧光RT-PCR检测,其中有两种方法检测结果呈阳性时,判定为检出ArMV;
当RT-PCR检测结果呈阳性,测定的序列为ArMV序列,则判定为检出ArMV
6.2结果记录与保存
记录各项实验数据,包括样品种类、来源,检测时间、地点、方法和结果等,血清学检测结果保存吸光值的数据报告,RT-PCR检测结果保存电泳照片,实时荧光RT-PCR检测结果保存采集的数据,序列 测定结果保存测序报告图.
附录A
(资料性附录)
南芥菜花叶病毒简介
A.1分布
欧洲:奥地利、白俄罗斯、比利时、保加利亚、塞浦路斯、捷克共和国、丹麦、芬兰、法国、德国、甸牙利、爱尔兰、意大利、拉脱维亚、立陶宛、卢森堡公国、摩尔多瓦、荷兰、挪威、波兰、罗马尼亚、俄罗斯、斯洛伐克、斯洛文尼亚、瑞典、瑞士、英国、乌克兰和南斯拉夫.
亚洲:日本、哈萨克斯坦、土耳其、伊朗.
非洲:南非.
北美洲:加拿大、美国.
大洋洲:澳大利亚、新西兰.
A.2形态特征
该病毒属线虫传多面体病毒,病毒粒体为等轴对称二十面体,直径约30nm,为双分体病毒,含有两条相对分子质量分别为2.4X10和1.4×10的单链RNA.超速离心后分为T(53S),M(93S)和B(126S)三个组分.该病毒具有一个外壳蛋白,相对分子质量为54kDa.
A.3寄主范围及症状
ArMV可侵染174属215种植物.主要为害的作物有大麻(Cawmabis satia)、啤酒花(Hamalasupulas)、黄瓜(Cacamis sativas)、西葫芦(Cacarbita pepo)、莴苣(Lactuca satia)、草莓(Fragaiaαncnaxsa)、葡萄(Vitisinifera)、香石竹(Dianhas caryoph yllus)、水f仙l(Narcisss tazetta)、蓄薇 (Rosa maliflora)、草木(Melilotus saveofens)、郁金香(Tulipa gesneriana)、芹菜(Apim graveo-lens)、薄荷(Mentha sppiperita)、T香(Syringa oblata)、大互豆(Glycine max)、甜菜(Beta vulgaris)、马铃薯(Solcmum tuerosm)草(Nicotiana tabcum)、番茄(Lycopericonesclenzam)、菜豆(Phaseoaxmlgaris)亚豆(Vignaungaicxlata )、蚕豆(Viciafaba)、防豆(Pisum sca7wam)、甜瓜(Cucumis melo)、花椰茶(Brassica oleraceaL. varbotrytis)、菠菜(Spinacia oleracea )、胡萝卜(Daxcascarota)等.
ArMV引起的最常见症状是叶片斑驳和脱落、植株矮化、严重畸型、耳突.症状随着寄主植物、病毒的分离物、裁培条件、季节和年份的不同而改变,有时候ArMV的侵染是隐症的,并不会在寄主植物上表现症状,
在鉴别寄主上产生的症状:
a)昆诺蔡(Chenopodinm quinoa)和苋色蔡(C.amaranricolor)接种叶上形成褪绿的局部斑点,然后形成系统性斑驳;b)黄瓜(C.sarivas):接种的子叶上产生褪绿的局部斑点,以及系统性脉带或黄色斑点:c)菜豆(P.uuigaris):产生坏死的局部枯斑、系统性坏死和畸型; d)矮牵牛(Petuiahybrida):产生局部坏死斑点或小的坏死环和系统性环斑,以及线状斑或明脉.