中华人民共和国国家标准
GB/T28078-2011
Detection and identification of Xanthomonas oryzae pv.oryzae(Ishiyama)Swings et al.Xanthomonas oryzae pv. oryzicola(Fang et al.)Swings et al.
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.
本标准起草单位：中华人民共和国湖南出人境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国厦门出人境检验检疫局.
本标准主要起草人：朱金国、赵文军、唐连飞、朱水芳、莫瑾、彭梓、陈红运、钟文英.
水稻白叶枯病菌、水稻细菌性条斑病菌 检疫鉴定方法
1范围
本标准规定了水稻种子和其他水稻材料的水稻白叶枯病菌Xanzhomonaxoryzae pv.aryzae（Xoo）和水稻细菌性条斑病菌XanthomonasoryzaePv.oryzicola（Xcola）的检疫鉴定以植物的形态学特征、生理生化特性、分子生物学和酶联免疫学技术作为依据，明确了田间观察、分离鉴定、样品保存的方法，
本标准适用于水稻材料和相关环境中水稻白叶枯病菌、水稻细菌性条斑病菌的检测，
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适用于本文件.
GB155691995农业植物调运检疫规程
ISTA国际种子检验规程
3方法原理
根据水稻植株的形态学特征进行田间观察，并采用分离培养、分子生物学和酶联免疫学筛选、生理生化鉴定以及致病性测定对植株材料上的水稻白叶枯病菌、水稻细菌性条斑病菌进行判定.
4设备和材料
4.1冷冻高速离心机：转速≤15000r/min.4.2PCR扩增仪4.3恒温培养箱：28C士1℃4.5天平：精度0.001g. 4.4显微镜：物镜头10×~100×.4.6高压灭菌器.4.7均质器：转速4000r/min~8000r/min.4. 8可调移液器：0.2 μL~1 μL，1 μL~10 μL，10 μL~100 pμL，100 μxL~1 000 μL4.9器具：灭菌的镊子、剪刀、称量勺. 4. 10吸管：1mL、10ml.4.11灭菌平Ⅲ：直径90mm，玻璃或一次性塑料平m.4.12三角瓶：100ml.
5培养基和试剂
5.1SPA培养基：见A.1
GB/T 28078-2011
5.20.001%吐温20-磷酸盐缓冲液.5.3革兰氏染色试剂：见A.2.5.4鞭毛染色试剂：见A.3. 5.5明胶液化培养基：见A.4.5.6氧化酶试剂：见A.55.7硝酸盐培养基：见A.6.5.8过氧化氢酶试验试剂：见A.7.5.10糖氧化和发酵测定培养基：见A.9. 5.9石蕊牛乳试剂：见A.8.5.11碳源利用试验培养基：见A.10.5.12水杨苷产酸试验培养基：见A.11.5.132，3.5-三苯基氯化四氮唑（TTC）.
6由间检验
水稻在整个生育期的叶片均可受害，在苗期、分期受害最重，通过田间观察可直接对水稻受害情况进行判断，水稻细菌性条斑病菌和水稻白叶枯病菌田间症状及相关资料参见附录B和附录C，对田 间检验有病害发生的植株，按以下操作进行抽样及实验室检验.
7抽样
水稻种子抽样可参照ISTA（国际种子检验规程>或者GB15569-19956.1方法进行.
8样品处理
8.1水稻种子
大量种子样品通常需先用蒸馏水冲洗以除去残片和表面的污染杂菌，以避免杂菌太多产生干扰.均质器打碎，制备样品提取液.如果是检测少量的种子样品，取20粒种子加人10mL灭菌的磷酸缓冲液，用灭菌和研体或是搅拌器将种子完全压碎制成提取液.
将样品提取液于22C~25C环境中放置4h~6h.旋涡混匀悬浮液5min，制备10×、100×和1000X三个稀释度的悬浮液，从原液及每个梯度稀释液中取0.3mL，分别放入到3个SPA的平Ⅲ中（每个平Ⅲ加人0.1mL）.用L-型玻璃棒将液体均匀涂布在SPA琼脂的表面.
若提取液杂菌较多，可考虑增加稀释梯度和接种平板的数量以提高检出率.
8.2植物组织材料
8.2.1无症状的组织
可将10g左右样品直接故人90mL0.001%吐温-磷酸盐缓冲液中，均质1min制备成样品提取液.按8.1方法进行稀释与涂布.
8.2.2未显症的可疑组织
用灭菌的剪刀剪成小块，将其置人SPA分离平板中，滴人2滴～3滴（约0.2mL）的生理盐水.放
置5min~10min，让细菌从这些组织中渗出，用灭菌的接种环施取渗出液，在SPA培养基上进行分离培养.
8.2.3受感染组织
从叶片损伤部位的前端切下2mm×7mm片段.将其放人70%的乙醇消毒中15s~30s，然后在试管中用灭菌蒸馏水清洗叶片2次～3次，最后将其置于SPA分离平板上.如植物组织材料上出现菌脓或菌痴，直接用接种工具取菌账或菌癫于SPA分离平板上涂布.
9分离
接种后每天观察SPA平板的菌株生长状况，水稻白叶枯病菌（Xoo）生长速度较俊，一般要在72h~96h才形成可见菌落.菌落呈圆形、光滑、表面凸起、粘稠，由黄白色逐渐变成淡黄色，在发射光 下不透明.菌落在第3天或第4天时只有小圆点般大小，在第5天至第7天时直径有1mm～2mm.水稻细菌性条斑病菌（Xcola）菌株则在48h~72h后出现，生长速度比Xoo快，菌落圆形、光滑、凸起、粘质，先为白色成熟后变浅黄色.菌落在第3天直径达到1mm
培养24h后开始观察菌落生长情况，标记并排除48h之内平板中出现的亮黄色菌落.选择浅黄色且黏液样的单个菌落接种于SPA培养基中，每个平Ⅲ挑取5个以上典型或疑似菌落进一步培养纯 化，以进行进一步生化鉴定试验.对疑似菌落也可以采用PCR方法进行初筛，或者采用水稻白叶枯病菌和水稻细菌性条斑病菌的ELISA试剂盒进行初步筛选（具体检测方法参照试剂盒说明手册），阳性结果再继续通过生化鉴定做进一步证实.
10PCR筛选试验
从分离培养的细菌菌株中提取DNA作为模板，进行PCR检测和电冰分析.用水稻白叶枯标准菌株或水稻细菌性条斑标准菌株基因组DNA作为阳性对照，用不含有水稻白叶枯菌株或水稻细菌性条斑菌株的植物组织材料或其他植物病原菌基因组DNA为阴性对照，用双蒸水作空白对照，进行PCR扩增：将扩增产物进行琼脂糖电泳分析.
将分离得到的可疑菌落接种SPA斜面，培养48h~72h后用无菌水洗下斜面上生长的菌苔，制成菌悬液.使用制备好的菌悬液按照附录D进行分子生物学鉴定.若测试菌株的PCR产物与阳性对照相对分子质量一致，继续进行生化鉴定试验.
11生化鉴定
11.1初步鉴定
挑取分离培养得到的符合特征的可疑菌落分别进行氧化酶试验，过氧化氢酶试验、革兰氏染色和鞭毛染色观察，黄单胞菌属菌为氧化酶阴性或延迟反应（15s~16s)，过氧化氢酶阳性，革兰氏染色阴性，单生极鞭杆菌.符合以上试验结果的菌落则初步鉴定为疑似黄单胞菌属（Xanthomonax）.
11.2硝酸盐还原试验
于28℃培养后的菌悬液中加人硝酸盐还原试剂，观察颜色反应，黄单胞菌不利用硝酸盐，为不变色的阴性反应.
