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T/GRHA 0002-2026
基于循环肿瘤DNA样本的非小细胞肺癌相 关基因变异高通量测序检测方法
The high-throughput sequencing method for detecting non-small cell lung cancer-associated genetic variants based on circulating tumor DNA samples
广东省呼吸与健康学会 发布
目次
前言... 引言. III AI1范围2 3 规范性引用文件 术语和定义,4缩略语 5技术应用,5.1应用场景5.2检测范围 '56实验原理, 5.3标本选择,7实验室分区、仪器设备、试剂及人员资质7.1实验室分区7.2仪器设备 7.3试剂.7.4人员资质.8方案选择.8.1使用商品化试剂盒. 8.2使用实验室自建程序9标本采集、保存与运输9.1血液标本. 59.2脑脊液、浆膜腔积液标本... 9.3标本信息. 510检测步骤.. 510.1游离核酸提取 10.2文库构建. 510.3高通量测序. 610.4数据处理和分析11性能确认或性能验证 11.1方案选择,11.2 性能验证. 811.3 性能确认时机11.4 11.5生物信息分析平台的性能确认, 测序平台的性能确认 811.6分析性能确认 812质量控制12.2室内质量控制 12.1室间质量评价附录A(规范性) 实验室分区的仪器设备和试剂要求, 11附录B(规范性) 附录C(资料性) 标本保存与运输要求 申请单模板示例, 12 13附录D(资料性) 文库构建方法及技术特点 14
参考文献. 15
前言
起草. 本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定
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本文件由广东省呼吸与健康学会提出并归口.
本文件起草单位:广州金域医学检验中心有限公司、广州呼吸健康研究院、中山大学附属第一医院、广州金域医学检验集团股份有限公司、中山大学孙逸仙纪念医院、山西省肿瘤医院、天津医科大学、广东省第二人民医院、山东省立第三医院、四川省肿瘤医院、中南大学湘雅三医院、九江市第一人民医院、 威海市立医院、威海市中心医院、乳山市人民医院、海南医科大学第二附属医院、吉林省人民医院、吉林市化工医院、北华大学附属医院、吉林大学第二医院、山西白求恩医院、广州中医药大学顺德医院、延边大学附属医院、蛟河市人民医院、艾吉泰康生物科技(北京)有限公司、山东第一医科大学附属省立医院、济南市第四人民医院、山西医科大学第二医院、山东中医药大学第二附属医院、广州医科大学、 江西省肿瘤医院、南昌县人民医院、大连大学附属中山医院、锦州医科大学附属第一医院、本溪市中心医院、珠海市人民医院、济南金域医学检验实验室有限公司、日照市人民医院、滨州市人民医院、山东医院、滨州医学院第二临床医学院、重庆市人民医院、无锡市第九人民医院、广州市第一人民医院、锦 省第二人民医院、昆明医科大学附属曲靖医院(云南省曲靖中心医院)、红河哈尼族彝族自治州第三人民州市中心医院、上饶市中心医院、通化市中心医院、鹰潭市人民医院、鹰潭一八四医院、合肥市第三人民医院、湖南省直中医院、南方医科大学南方医院、哈尔滨医科大学附属第四医院、台州市中心医院、 青海红十字医院、重庆市中医院、宁夏回族自治区人民医院、贵溪市人民医院.
本文件主要起草人:祁德波、周承志、柯尊富、叶竹佳、相科羽、李童童、刁恺媛、李慧源、马骥、程雅婷、刘向前、莫南勋、李维、成尚涛、刘欣宜、毛蕾、段朝晖、都彦风、申艳娜、王蓉、程远雄、 庄学伟、张艳丽、杨红辉、刘彩虹、周进、段训凰、王晨亮、宋宇、谭聪慧、孙晓腾、于勇、刘成、芦小单、吴明达、李海霞、杨鑫磊、林晓燕、常哲兴、田新瑞、高晓玲、唐文军、孙平丽、冯慧晶、乔冠英、林贞花、权海燕、陈雪岩、朴龙一、屈武斌、杨菁、宫琪、刘传杰、陈涛、曲芸芸、王志刚、王立 富、陈文学、涂淑芬、李小松、赵志龙、薛洪省、李昆、王学哲、张亚南、孙涛平、赵一诺、刘明涛、阚玉玲、田亮、李宏伟、张淑香、朱顺挥、张玉强、朱明松、股剑、吴斌、耿聆、刘丹、刘莲风、陈燕枝、王志强、吴兴业、程红平、周美秀、陶宗婷、王晖、朱一喜、赵钢艳、刘来昱、才旭、路德娟、贾 丹丹、卢洪胜、曹学全、马登云、金海、华伟奇、王陈、汪涛.
引言
医疗时代的到来,基于驱动基因变异的靶向治疗已成为NSCIC患者--尤其是晚期患者的标准治疗模式. 肺癌是全球发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(NSCLC)约占85%.随着精准传统的基因变异检测依赖于组织活检样本,但该方法存在诸多局限性,如侵入性强、难以重复取样、部分患者无法获取足够组织以及无法全面反映肿瘤异质性等问题.近年来,基于循环肿瘤DNA(ctDNA)的 液体活检技术因其无创性、可重复性和实时监测肿瘤动态变化的优势,成为NSCLC诊疗领域的重要突破.ctDNA检测能克服传统组织活检的局限性,尤其适用于无法获取组织样本或需动态监测治疗反应的患者,为临床决策提供了新的技术路径.
高通量测序(NGS)技术以其高通量、高灵敏度和可同时检测多个基因及多种变异类型的优势,成为ctDNA检测的核心技术.尤其对于丰度极低的ctDNA(在血浆游离DNA中占比通常低于1%),NGS技术能够通过深度测序有效检出低频突变,为临床提供了全面而精准的分子诊断信息.
然而,现有规范多为肿瘤组织样本NGS检测的通用性指导,或是对液体活检和ctDNA检测的原则性建议,尚未针对NSCLC这一高发疾病的特异需求,对关键环节如受检者适用范围、标本采集与处理、循环游离DNA(cfDNA)提取、文库构建、测序平台与深度要求、生物信息学分析流程、室内质量控制与外部 质量评价等形成面向临床应用的成体系技术要求和质量标准.
因此,为规范基于ctDNA样本的NSCLC相关基因变异高通量测序检测全流程,保障检测质量,提升结果的准确性和一致性,推动该技术在临床的规范化应用,特制定本团体标准.本标准旨在为相关实验室 提供一套科学、可行、统一的操作指南和质量评价体系,从而促进液体活检技术在我国NSCLC精准诊疗领域的健康发展,最终使广大患者受益.