中华人民共和国国家标准
GB/T 33919-2017
Specification for exchanging biological digital specimen data
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
目次
前言1范围2规范性引用文件3术语和定义4总则5数据项目6数据格式.7数据交换方式 附录A(资料性附录)XML数据项格式附录B(资料性附录) JSON数据项格式 10附录C(资料性附录) 中转数据库表格式 12附录D(资料性附录)格式范例 14附录E(资料性附录)中转电子表格格式 16参考文献 18
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.
本标准由中国标准化研究院提出并归口.
中华人民共和国深圳出人境检验检疫局、中华人民共和国太仓出人境检验检疫局. 本标准起草单位:深圳市检验检疫科学研究院、太仓市海舟科技咨询有限公司、中国标准化研究院、
本标准主要起草人:娄定风、吕飞、张育润、李芳荣、刘新娇、李秋枫、陈冬美、徐浪、焦懿、陈志群、程颖慧、冯建军.
生物数字标本数据交换规范
1范围
本标准规定了计算机系统中用于交换的生物数字标本数据的项目、格式和交换方式.本标准适用于我国生物数字标本数据的交换.
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T7408数据元和交换格式信息交换日期和时间表示法 GB/T16831-2013基于坐标的地理点位置标准表示法SN/T2340-2009有害生物图像摄取操作规范
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件.
3.1生物organism植物、动物及微生物(包含病毒)等具有生命的有机体.
生物分类学确定共性范围的等级.注:现代生物分类采用的有界(Kingdom)、](Phylum)纲(Class)、目(COrder) 科(Family1、属(Genus)、种(Species)等7个必要的阶元.
分类单元taxon
具体的分类群,即分类工作中的客观操作单位,有特定的名称和分类特征.示例:一个具体的属、一个具体的科、一个具体的目等.
3.4学名scientific name分类单元的拉丁文或拉丁化的科学名称.
3.5异名synonym
同一个分类单元未取得优先权的可用名.
3.6分类地位taxonomic position
生物所属生物分类单元在分类系统中,从界到当前分类阶元的各分类单元名称的集合.
GB/T 33919-2017
生物的关系,两种生物在一起生活,一方受益,另一方受害,后者给前者提供营养物质和居住场所.
被其他生物所寄生的生物.
特定生物发生的地区,即官方划定的一个国家的全部或部分,或若干国家的全部或部分.
生活史life cycle
3.11
数字标本digital specimen
生物的形态、生物学、地理分布等相关资料经过数字化处理形成的文字、图像和视類等格式的计算机数据集合,
4总则
本标准规定在不同计算机系统间进行生物数字标本数据交换的数据项目、格式和数据交换方式.
所述数据项目分为必备项目和从属项目,必备项目为必须参与数据交换的项目,项目缺乏资料时应用协商确定的术语或符号填充.从属项目为数据交换双方商定的项目.
DDThhmmss,其中YYYY、MM、DD分别表示年、月、日,T用于分隔日期与时间,hh mm ss分别表示 本标准中日期和时间的表示法见GB/T7408,采用公历日期和时间标示法的基本格式YYYYMM-小时、分、秒,采用通用的24h计时系统.日期和时间表示中长度不足的采用前置=0”.
本标准中纬度、经度和高程的表示法见GB/T16831一2013.
本标准项目中有多组数据时,采用2个间隔符号“"(|的ASC码值124)隔开.
写时不为斜体.大写字母字符申为可自由命名的字符串.小写字母单词及标点符号为语法中固有的关 本标准中数据交换软件语法格式中,斜体字符申可自行书写,斜体文字说明字符串的含义,实际书键字,不能改变,
5数据项目
5.1标本编号
标本编号为数据输出方系统中标记生物数字标本所使用的不重复的唯一标识.从属项目,为中文或其他文种.
5.2数据源更新时间
数据输出方系统中生物数字标本资料更新的时间,无任何更新的资料时采用新建时间.必备项目,为数字和英文字母.
5.3生物名称
生物名称为生物数字标本归属的生物分类单元名称.