NY
中华人民共和国农业行业标准
NY/T 4913-2025
Identification of pear varieties and their essentially derivedvarietiesMNPmarkermethod
中华人民共和国农业农村部 了发布
目 次
前言
1范围..规范性引用文件3 术语和定义原理仪器设备 试剂和材料7操作程序 6质量控制数据分析附录A(规范性) 结果判定与表述 MNP标记和标记检测引物附录B(资料性) 溶液配制 120附录C(资料性)品种鉴定流程示例 121
前言
本文件按照GB/T1.1一2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由中华人民共和国农业农村部种业管理司提出.
本文件由全国植物新品种测试标准化技术委员会(SAC/TC277)归口.
本文件起草单位:江汉大学、农业农村部科技发展中心、武汉明了生物科技有限公司、中国农业科学院果树研究所、湖北省农业科学院果树茶叶研究所.
本文件主要起草人:李甜甜、彭海、周俊飞、方治伟、张秀杰、董星光、陈红、张凯渐、曹玉芬、李论、田路明、张静、陈启亮、涂俊凡、高利芬、陈利红、肖华锋.
梨品种及其实质性派生品种鉴定 MNP标记法
1范围
本文件规定了利用多核苷酸多态性(Multiple Nucleotide Polymorphism,MNP)标记法进行梨(PyrusL.)品种及其实质性派生品种鉴定的术语和定义、原理、试剂和材料、仪器设备、操作程序、质量控 制、数据分析、结果判定与表述.
本文件适用于梨品种及其实质性派生品种的鉴定.
2规范性引用文件
该日期对应的版本适用于本文件:不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件. 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款.其中,注日期的引用文件,仅
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB/T38551植物品种鉴定MNP标记法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件,
3. 1
多核苷酸多态性multiple nucleotide polymorphism,MNP
在一段核昔酸序列中,由一个或多个核昔酸变异引起的序列多态性.
[来源:GB/T38551,3.1,有修改]
3.2
实质性派生品种essentially derivedvariety,EDV
由原始品种实质性派生,或者由该原始品种的实质性派生品种派生出来的品种,与原始品种有明显区别,并且除派生引起的性状差异外,在表达由原始品种基因型或者基因型组合产生的基本性状方面与原始品种相同.
平均覆盖倍数average coverae
在基因组上比对到标记位点上的测序片段的总数与标记位点总数的比值.
检出标记位点detectedmarkers
至少有一个等位基因型且有20条及以上测序片段支持的标记位点.
4原理
梨品种的基因组中存在着能够世代稳定遗传的MNP位点,不同梨品种间同一组MNP位点的序列上可能存在差异,这种差异可通过基于PCR、二代高通量测序以及生物信息学方法进行检测,进而区分不同的品种.
5试剂和材料
除非另有规定,仅使用分析纯试剂,实验用水符合GB/T6682中规定的一级水的要求.
5.1多重PCR扩增与文库构建试剂盒
应匹配MNP标记和标记检测引物,以及高通量测序试剂盒.