中华人民共和国出入境检验检疫行业标准
出口食品常见过敏原LAMP系列检测方法 第17部分:荞麦
Food allergen detection with LAMP methods for exportPart 17:Buckwheat
中华人民共和国 国家质量监督检验检疫总局 发布
前言
SN/T4419《出口食品常见过敏原LAMP系列检测方法》由下列部分组成:
第1部分:开心果:第2部分:腰果; 第3部分:胡机;第4部分:榛果:第5部分:杏仁;第7部分:巴西坚果; 第6部分:扁桃仁:第8部分:澳测坚果;第9部分:栗子第10部分:大豆;第12部分:花生: 第11部分:羽扇豆;第13部分:葵花籽:第14部分:芝麻;第15部分:大麦; 第16部分:小麦;第17部分:荞麦:第18部分:芥末:第19部分:胡萝卜;第21部分:牛奶: 第20部分:芹菜:第22部分:虾.
出口食品常见过敏原LAMP系列检测方法 第17部分:荞麦
1范围
SN/T4419的本部分规定了出口食品中过敏原荞麦成分的环介导等温扩增(LAMP)检测方法.
本部分适用于食品及其原料中过敏原养麦成分的定性检测.本部分所规定方法的最低检测限(1OD)为0.5%(质量分数).
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方GB/T27403-2008实验室质量控制规范食品分子生物学检测 SN/T1961.18-2013出口食品过敏原成分检测第18部分: 实时荧光PCR方法检测荞麦成分
3术语、定义和缩略语
3.1术语和定义
下列术语和定义适用于本3.1.1
过敏原allergen
又称致敏原或变应原,是指能够引 态反应的抗原3.1.2
荞麦buckwheat
学名:Fagopyrumesculentum,别名净肠草,蓼科荞麦属植物,粮食作物,其中甜荞(F.esculenrum)和苦荞(F.tataricum)是两种主要的栽培种.
3.2缩略语
下列缩略语适用于本文件,dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleoside triphosphate)LAMP,环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification)TritonX-100聚乙二醇辛基苯基醚
4防污染措施
环介导等温扩增检测过程的防污染措施应符合GB/T27403-2008中附录D的规定.
5方法提要
样品经研磨后,提取DNA.以DNA为模板,采用荞麦过敏原蛋白基因特异性检测引物进行LAMP扩增,通过颜色变化观察判定是否存在养麦成分.
6LAMP检测方法
6.1原理
根据养麦过敏原蛋白基因序列设计内引物、外引物各一对,特异性识别靶序列上的6个独立区域.在链置换型DNA聚合酶的作用下,内引物与模板DNA退火、延伸,并利用外引物与模板DNA的退火、延伸,并利用外引物与模板DNA的退火延伸置换出内引物合成链.由于内引物与相邻区域存在互补区,游离的内引物合成链折叠成茎-环结构,以自身为模板,启动链置换扩增循环,合成长度不一的大 量茎-环结构DNA.加人显色液,即可通过反应液的颜色变化观察判定结果.DNA聚合反应析出的焦结果,
显色液显色原理:SYBRGreenI是一种结合于dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色荧光的染料.在游离状态下,SYBRGreenI发出微鸦的荧光、但一旦与dsDNA结合后,荧光大大增强,因此, SYBRGreenI荧光的强度与dsDNA的量正相关,可以根据LAMP反应液的荧光强度测定反应体系中的 dsDNA 的量.
6.2仪器和设备
6.2.1超纯水发生器(分子生物学级别).6.2.2水浴锅或加热模板:65C±1C和80C±1℃.6.2.3离心管:0.1mL、1.5ml6.2.4计时器.6.2.5移液枪:量程0.5μl~10pL、量程10μl~100pL、量程100pL~1000μl
6.3试剂和材料
除另有规定外,试剂均为分析纯或生化试剂.6.3.2CTAB提取缓冲液(20g/L CTAB. 1. 4mol/LNaCl 0.1 mol/L.Tris-HCl.0.02 mol/L. 6.3.1实验用水:应符合GB/T6682中一级水的规格.Na EDTA.pH 8.0).6.3.3 CTAB 沉淀液(5 g/L. CTAB.40 mmol/L NaCl).6.3.4NaC1 溶液;1.2mmol/l6.3.5蛋白酶K(20mg/ml) 6.3.6dNTPs溶液:每种脱氧核糖核苷酸浓度10mmol/L6.3.7BstDNA聚合酶:酶浓度8U/μ16.3.810×Thermol Pol缓冲液:含200mmol/L.Tris-HCl(pH 8.8)、100mmol/L.硫酸铵、100mmol/1.氯6.3.9硫酸镁溶液:50mmol/1 化钾、20mmol/L硫酸镁、1%TritonX-100.6.3.10甜菜碱溶液:5mol/L.6.3.11显色液:SYBRGreenI荧光染料.1000X.2
SN/T 4419.17-2016
6.3.12引物:根据荞麦过敏原蛋白基因设计一套特异性引物,包括外引物F3/B3.内引物FIP/BIP,见表1.
表1引物序列
名称 编号 序列外侧上游引物(F3) 5'-ATCCTCGGACCGAGATGG-3'外侧下游引物(B3) 5′-AGTCCTTCTCTTCCTGCCT-3*LAMP引物序列 内侧上游引物(FIP) S'-CTCCGACAACCTGGACTCTTCCAACTTGAACGCGCACAGC-3'内侧下游引物(BIP) S'-AGTGTGTTCGACGACAACGTGCTCAACACCACTGCGAATCC-3*
6.4DNA提取
6.4.1称取100mg已制备好的样品至1.5mL离心管中,加人1mL.CTAB提取缓冲液和10pL.蛋白6.4.212000g离心10min.吸取上清液700pl至一新1.5mL离心管中. 酶K,65℃1h.期间每隔10min振荡混匀.6.4.3加人490μl氯仿,振荡混合后,12000g离心10min6.4.4吸取500μL上清液至一新1.5mL管中.6.4.5加人2倍体积CTAB沉淀液,混匀后室温静置60min.12000g离心10min.6.4.7加人350uL氯仿,高速激涡振荡混匀.12000g离心10min. 6.4.6弃去上清液,加人350pl.1.2mmol/LNaCl溶液充分溶解沉淀.6.4.8吸取上清液至一新1.5mL管中.加入0.8倍体积异丙醇,混匀,-20C静置20min,12000g离心10 min.6.4.9弃去上清液,用70%乙醇洗涤沉淀一次,12000g离心10min.
6.4.10弃去上清液,晾干,加入100μLTE缓冲液,溶解DNA沉淀,-20“C保存备用.
6.5实验步骤
6.5.1阴性对照、阳性对照和空白对照的设置
阴性对照:采用不含有待测基因序列的植物基因组DNA为模板.
阳性对照:采用含有待测基因序列的植物DNA作为模板或含有目的基因序列的质粒DNA代替DNA模板.
设两个空白对照:
提取DNA时设置的提取空白对照(以水代替样品):
LAMP反应的空白对照(以DNA溶解液代替DNA模板).
6.5.2荞麦LAMP反应体系
LAMP反应体系见表2,每个样品各做2个平行管.加样时应使样品DNA溶液完全加人反应液中,不要粘附于管壁上.在反应体系配制完成后,将1pL显色液演在管盖内侧,盖管盖时应小心.防止显色液混合进入反应液中.