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GB/T 34794-2017 琼脂糖凝胶回收试剂盒测定通则.pdf

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中华人民共和国国家标准

GB/T 34794-2017

琼脂糖凝胶回收试剂盒测定通则

Guidelines for DNA gel purification kit

中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布

前言

本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.

本标准由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口.

本标准起草单位:中国测试技术研究院生物研究所、中国测试技术研究院、凯杰企业管理(上海)有限公司、四川中测生物科技有限公司.

本标准主要起草人:周李华、史谢飞、马丽侠、唐小波、侯晓妮、王智、李怀平、叶德萍、孙登峰、谭和平.

琼脂糖凝胶回收试剂盒测定通则

1范围

本标准规定了柱式琼脂糖凝胶回收试剂盒的DNA回收产物评估指标及测试方法.本标准适用于柱式琼脂糖凝胶回收试剂盒的测定.

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的.凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法GB/T 11165实验室pH计GB/T26813双光束紫外可见分光光度计JJG646移液器检定规程YY/T0087电泳装置YY/T0657医用离心机

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件,

3.1

DNA 纯化DNA purification

采用适当方法降低可以观察到的或可测量到的连接、酶切、标记、扩增等抑制物的过程,为获得更高纯度DNA

DNA回收率DNA recovery rate

即DNA回收得率,DNA目的片段回收后与回收前的产量百分比.

3.3最大上样量column reservoir capacity

单个吸附柱的单次最大上样体积.

3.4

吸附柱的承载量bindingcapacity

单个吸附柱每次最多可吸附DNA的量.其决定了单次回收的DNA最大量.

4原理

心柱上作为吸附剂,在高盐(如3 0mol/1~5.0mol/L盐酸胍>低pH(5.0mol/L~6.5mol/L)状态下, 介质吸附法是一种常用的纯化核酸的方法.柱式回收试剂盒是将硅胶膜或其他吸附介质固定在离

GB/T 34794-2017

吸附柱专一性地吸附DNA:而在低盐(TE或者2.5mmol/LTris-HCI)或水溶液状态下,DNA被洗脱下来.

5仪器和设备

5.2水浴锅或金属浴:温度范围60℃~70℃. 5.1离心机:转速10000r/min以上,应符合YY/T0657的要求.5.3电泳系统,应符合YY/T0087的要求.5.4凝胶成像系统.5.5 可调移液器:0.5 μL~10 μL、10 μL~100μL、100μL~1 000μL、0.5 mL~5 mL,应符合 JJG 646的要求.5.6紫外分光光度计,应符合GB/T26813的要求. 5.7pH计,应符合GB/T11165的要求.5.8天平:精度为0.1mg.5.9刀片,

6试剂

除非另有说明,在分析中仅使用分析纯试剂,水为GB/T6682规定的一级水.试剂溶液(含水

溶液)宜大体积配制、小体积分装经高压灭菌后使用,不宜高压灭菌的试剂应用0.22μm膜过滤除菌;酶溶液应避免反复冻融.6.1三羟甲基氨基甲烷(Tris).6.2盐酸(Hydrochloric acid,HCl). 6.3氢氧化钠(Sodium hydroxide,NaOH).6.4乙酸钠(sodium acetate,NaAc)溶液:3mol/L,用乙酸调pH至5.2,0.22ym膜过滤.6.5乙二胺四乙酸二钠(ethylenediaminetetraacetic acid disodium salt Na EDTA CHNO Na).6.7琼脂糖(Agarose,AG). 6.6无水乙醇(alcohol.CH;OH),4C保存及使用.6.8核酸染剂(如 Gold View等染料).6.9上样级冲液(Loading buffer).6.10DNA 标准品(HindIl酶切的aDNA产物).6.11100倍电泳缓冲液溶液(TAE):4mol/LTris-HCl(pH8.0),2mol/L醋酸钠 200mmol/LEDTA.使用时稀释100倍.6.12TE缓冲液(pH 8.0):10mmol/LTris-CI 1 mmol/1EDTA,使用HCl或NaOH调节 pH,4℃ 保存备用.

7试验方法

7.1标准DNA溶液的配制

液备用. 将不同的DNA Fragment(10 bp~20 000 bp)用 TE缓冲液分别配制成1 μg/μL的DNA 标准溶

7.1.1DNA Fragment 1(片段范围为 10 bp~100 bp 不含 100 bp):20 bp(记为 DNA 1)50 bp(记为DNA2)、80bp(记为DNA3)或取均匀分布在范围内的任意其他3个不同大小的DNA片段.

7.1.2DNA Fragment 2(片段范围为 100 bp~1 000 bp,不含 1 000 bp):100 bp(记为 DNA 4)、500 bp(记为DNA5)、800bp(记为DNA6)或取均匀分布在范围内的任意其他3个不同大小的DNA片段.

000002 000 bp(记为 DNA 8)、5 000 bp(记为 DNA9)、8000 bp(记为DNA 10)或取均匀分布在范围内的任 意其他4个不同大小的DNA片段.

7.1.4DNA Fragment 4(长度范围为 10 000 bp~20 000 bp 不含 20 000 bp):10 000 bp(记为 DNA11)、15 000bp(记为DNA 12)、20 000 bp(记为 DNA13)或取均匀分布在范围内的任意其他3个不同大小的DNA片段.

7.2吸附柱的最大上样量

用移液枪向吸附柱中加人蒸馏水至刻度,记录加入的蒸馏水体积即为吸附柱的最大上样量.

7.3吸附柱的承载量

将800bp(或按照待测试剂盒说明中可回收片段的任意片段)DNAFragment溶液按照表1体系混合DNA溶液与胶回收试剂盒的溶胶液后加人吸附柱.

表1吸附柱的承载量

试验项目 DNA溶液/sL 落胶液/L DNA上样量/μk试验 I 5 95 5试验Ⅱ 10 90 10试验 II 15 85 15试验IV 20 80 20试验V 30 70 30

按照待检测的试剂说明书进行后续清洗、洗脱步骤收集回收液,采用紫外分光光度计法,测定回收的DNA溶液在260nm处的吸收值,利用A=1相当于50μg/mL的DNA来计算回收DNA的浓度,乘以回收液体积可得回收的DNA总量,以DNA上样量为横坐标绘制回收量曲线图,曲线上限即为吸附柱的承载量.

7.4DNA回收产物的质量测定

7.4.1纯度的测定

纯度按照以下步骤进行测定:

a)根据试剂盒说明书,选取待测试剂盒可回收片段范围内的任意3个不同大小的DNA标准落液进行琼脂糖凝胶电泳(上样时确保避免损坏凝胶和样品无溢出).电泳完成后在紫外凝胶成

和试剂用量按照待测的胶回收试剂盒说明书进行.b)采用紫外分光光度计法将试剂盒回收得到的DNA溶液进行适当稀释,使样品溶液在260nm处的吸收值在0.1~0.5之间,以稀释液做参比,测定样品溶液在260nm、280nm、230nm处

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