中华人民共和国国家标准
GB/T 36810-2018
Detection and identification of Fusarium oxysporum (Schlecht.)f. sp.FragariaeWinks&Williams
中国国家标准化管理委员会 国家市场监督管理总局 发布
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口.本标准起草单位:中华人民共和国天津出人境检验检疫局.本标准主要起草人:刘跃庭、罗加风、牛春敬、崔铁军、廖芳.
草莓枯萎病菌检疫鉴定方法
1范围
本标准规定了草莓枯萎病菌的检疫鉴定方法.本标准适用于草莓苗中及其携带土壤中草莓枯萎病菌的检疫鉴定.
2草莓枯萎病菌的基本信息
中文名:草莓枯菱病菌
学名 :Fusariu o.xysporum (Schlecht.) f. sp . fragariae Winks &. Williams
英文名:fusarium wilt of strawberry
分类地位:草莓枯萎病菌属真菌界(Fungi),子囊菌门(Asycota),盘菌亚门(Pezizomycotina),粪壳菌纲(Sordariomycetes),肉座菌目(Hypocreales),丛赤壳科(Nectriaceae),镰刀菌属(Fusariam).
传播途径:病菌依靠带菌种苗和土壤进行远距离传播.
草莓枯萎病菌的其他信息参见附录A.
3方法原理
定依据.
4仪器用具和主要试剂
4.1仪器用具
显微镜、超净工作台、生物培养箱、电子天平、高压灭菌锅、常规冰箱(一20C).PCR扩增仪、电泳仪、凝胶成像仪、高速冷冻离心机、恒温水浴锅.
培养皿、三角瓶、镊子、手术剪、手术刀、接种针、移液器、酒精灯.
4.2主要试剂
乙二胺四乙酸(EDTA)、十二烷基磺酸钠(SDS)、Tris-HC1、异戊醇、三氯甲烷、无水乙醇、70%乙醇、氯化钾、氯化镁、蛋白酶K、引物FofraF/FofraR、Taq聚合酶等分子生物学试剂.或用植物组织及 真菌基因组提取试剂盒提取DNA.蔗糖、葡萄糖、琼脂、青霉素、链霉素、0.5%次氯酸钠(NaCIO).
马铃薯蔗糖培养基(PSA)、马铃薯葡萄糖培养基(PDA)的制备参见附录B
5病菌的鉴定
5.1症状检查
取待检植株,观察植株有无生长不良、矮小衰弱及腐烂症状,下部叶片是否变紫红色萎,心叶是否
GB/T 36810-2018
变黄绿或黄色,纵切叶柄、果梗和根部,检查维管束是否变色(参见附录A中图A.1),对变色的可疑材料进行分离培养.检查植株有无附着土壤,若发现土壤,对土壤进行分离培养.
5.2病原菌的分离培养
5.2.1种苗中病原菌的分离培养
变色的可疑材料用0.5%次氯酸钠表面消毒5min,再用灭菌水冲洗30min,剪成约3mm~5mm孢子及厚垣孢子着生情况和形态特征. 小段置PSA或PDA平板上25℃,全光照下培养,培养48h后开始观察菌落形态、大分生孢子、小分生
5.2.2土壤中病原菌的分离培养
0.5mL土壤稀释液涂抹于PSA或PDA平板上,每处理涂抹5个培养Ⅲ,25C,全光照下培养,培养 取2g土壤放人200mL灭菌水中,用磁力棒搅拌30min,使其充分混匀,悬浮液稀释10倍,取48h后开始观察菌落形态、大分生孢子、小分生孢子及厚垣孢子着生情况和形态特征.
5.3分子生物学鉴定
5.3.1引物
采用特异性引物FofraF/FofraR进行扩增,目标片段为239bp.FofraF:5'-CAGACTGGGGTGCTTAAAGTT-3 FofraR:5'-AACCGCTAGGGTCGTAACAAA-3
5.3.2DNA提取
基因组提取试剂盒提取DNA,提取步骤详见使用说明. 可疑菌株在PSA或PDA上生长7d左右,取菌丝提取DNA(参见附录C),也可用植物组织及真菌
5.3.3PCR反应
PCR反应体系总体积25pL,包含:EmeraldAmp Max PCRMaster Mix(2× Premix)(CodeRR320)12.5μL;ddHO9.0pL;引物各1.0μL;DNA模板1.5μL(30ng/μL).PCR反应程序:94℃ 预变性2min;94C变性1min,63C复性1min.72℃延神1min,30个循环;72C7min,保存于4℃C.
扩增产物在2.0%琼脂糖凝胶1XTAE缓冲液中电泳,EB染色后凝胶成像,分析是否出现目标片段大小的单带.
6签定特征
6.1培养性状
在PSA培养基平板上菌落突起,白色致密呈絮状,高3mm~5mm,菌落正面有同心轮纹,背面菌落呈紫色.在PDA培养基上,2d后出现白色菌丝,3d后开始产孢,7d后菌落呈圆形,边缘白色,向内逐渐变成粉红色,菌丝细绒状、蓬松,背面菌落呈紫色(参见附录D中图D.1).
6.2形态特征
菌丝有隔,小型分生孢子居多,着生于单生瓶梗上,常在瓶梗顶端处聚成假头状,无色,单孢,长椭圆形,椭圆形或卵形,无或有1个分隔,大小为(3.9μm~13.0μm)×(2.6μm~5.2pm);大型分生孢子较 少,肇刀形或新月形、有脚胞.1个~4个分隔,多为3隔,大小为(13.0m~36.4pm)×(2.6gm~2
GB/T 36810-2018
5.2μm).厚垣孢子间生或顶生,球形,大小为(5.2μm~13.00μm)×(5.2pμm~13.0pm)(参见附录D中图D.2).草莓枯萎病菌与其近似种的区别参见附录E.
6.3PCR特异性产物
引物FofraF/FofraR特异性 PCR扩增片段为 239 bp.
7结果判定
病原菌培养性状符合6.1中描述形态特征符合6.2中描述,PCR特异性扩增片段符合6.3中描述可鉴定为草莓枯萎病菌.
8样品保存
8.1样品保存与处理
样品经登记和经手人签字后妥善保存.对检出草莓枯萎病菌的样品应保存于4C冰箱中,以备复核.该类样品保存期满后应经高压灭菌后方可处理.
8.2菌株保存与处理
从检测样品中分离并鉴定为草莓枯萎病菌的菌株,应妥善保存.将菌株接种于PSA培养基斜面时用病菌分生孢子作冻干菌种保存.保存期满后高压灭活处理. 上,存活后置于4℃~8C黑暗条件下保存,定期(3个月)转接,以防止病菌死亡,至少保存6个月,必要
8.3结果记录与资料保存
实验记录包括样品的来源、种类、时间,实验的时间、地点、方法和结果等,并有实验人员和审核人员签字.