GB/T35900.1-2018
前言
GB/T35900(动物流感检测》目前分为3个部分: 第1部分:H1亚型流感病毒核酸荧光RT-PCR检测方法; 第2部分:H3亚型流感病毒核酸荧光RT-PCR检测方法: 第3部分:H1和H3亚型流感病毒核酸双重荧光RT-PCR检测方法. 本部分为GB/T35900的第1部分。
本部分按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本部分由中华人民共和国农业部提出。
本部分由全国动物卫生标准化技术委员会(SAC/TC181)归口。
本部分起草单位:中华人民共和国北京出人境检验检疫局、中国农业大学。
本部分主要起草人:乔彩霞、谷强、高志强、刘环、蒲静、张鹤晓、刘金华、孙洪磊、张伟、张利峰。
GB/T35900.1-2018
引言
本文件的发布机构提请注意,声明符合本文件时,可能涉及到本文件4.1.8与“检测H1和H3亚型 流感病毒的核苷酸序列和试剂盒”相关的专利的使用。
本文件的发布机构对于该专利的真实性、有效性和范围无任何立场。
该专利持有人已向本文件的发布机构保证,他愿意向任何申请人在合理且无歧视的条款和条件下, 就专利授权许可进行谈判。
该专利持有人的声明已在本文件的发布机构备案。
相关信息可以通过以下 联系方式获得: 专利持有人:中华人民共和国北京出入境检验检疫局。
地址:北京市朝阳区甜水园街6号。
请注意除上述专利外,本文件的某些内容仍可能涉及专利。
本文件的发布机构不承担识别这些专 利的责任。
GB/T 35900.1-2018
动物流感检测 第1部分:H1亚型流感病毒核酸荧光 RT-PCR检测方法
1范围 GB/T35900的本部分规定了检测H1亚型流感病毒核酸的荧光RT-PCR操作方法, 本部分适用于猪和禽及其产品中H1亚型流感病毒核酸的检测。
2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法 GB/T19438.1-2004禽流感病毒通用荧光RT-PCR检测方法 GB19489实验室生物安全通用要求 3缩略语 下列缩略语适用于本文件。
荧光RT-PCR实时荧光反转录聚合酶链反应(real-time reverse transcript polymerase chain re action) Cr(或Cp)值每个反应管内的荧光信号量达到设定的阔值所经历的循环数(cyclethreshold,or crossing point) cRNA互补RNA(plementRNA) DEPC焦碳酸二乙酯(diethylpyrocarbonate) FAM骏基荧光素(carboxyfluorescein) LNA锁核酸(lockednucleic acid) PBS磷酸盐缓冲液(phosphate buffer saline) RNA核糖核酸(ribonucleicacid) TAMRA骏基四甲基罗丹明(carboxytetramethylrhodamine) 4试剂和材料 4.1试剂 4.1.1总则:除非另有说明,所用试剂均为分析纯,所用液体试剂均需使用无RNA酶的容器进行分装。
4.1.2TRlzol:2C~25C保存. 4.1.3氧仿:2C~8C预冷。
4.1.4异丙醇:一20C预冷。
GB/T 35900.1-2018 4.1.5DEPC水:见附录A中A.1。
4.1.675%乙醇:用新开启的无水乙醇和DEPC水配制,一20C预冷。
4.1.7PBS(含牛血清白蛋白、青霉素和链霉素):配方见A.2. 4.1.8引物、探针序列及反应液配方:见附录B。
4.1.9阳性对照为灭活的H1亚型动物流感病毒或体外转录的H1亚型流感病毒HA基因cRNA溶 液:阴性对照为已知流感病毒阴性的动物组织悬液。
4.2仪器设备及耗材 4.2.1荧光PCR检测仪及配套反应管(板) 4.2.2高速台式冷冻离心机(最高离心速度不低于120001/ 4.2.3台式离心机。
4.2.4振荡器。
4.2.5组织匀浆器。
4.2.6冰箱(2℃20C两种)。
4.2.7微量移液器(5L、10μL、100gL、1000pL)及配套吸头(无核酸酶). 4.2.81.5ml离心营(无核酸两) 5实验室的标准化设置与生物安全管理 本方法的实验室设置与管现见B/T录C实验室生物安全管理见GB19489 6样品的采集与前处理 6.1总则 采样过程中样本不得交叉污,采样及样品前处理过程中应戴一次性手 6.2采样及处理工具 6.2.1采样专用商品化棉减子、剪刀、镊子、研体、5mL采样管、一次性采样袋。
6.2.2除棉拭子和采单袋外,上述取样工具应经121C士2C,15min高压天并烘干或经160C干 烤2h。
6.3样品采集 6.3.1拭子样品 活动物采集拭子样品,根据动物种类可采集咽啦拭子、泄殖腔拭子(禽类)或鼻拭子(猪),采集方 法如下: 取咽喉拭子时将拭子深人喉头及上额裂来回刮2次~3次并旋转,取分液; 取泄殖腔拭子时将拭子深人泄殖腔旅转一圈并沾取少量粪便: 一取鼻拭子时将拭子深人鼻腔来回刮2次~3次并旋转,取分泌物。
将采样后的拭子放人盛有2.0mLPBS(含牛血清白蛋白、青霉素和链霉素)的采样管中,编号。
6.3.2组织样品 病死动物采集肺脏或气管等组织,用无菌剪、锻采集待检组织,装人一次性采样袋或其他灭菌容 2
GB/T 35900.1-2018 器,编号。
6.4样品购运 样品采集后置保温箱中,加入预冷的冰袋,密封,24h内远实验室。
6.5样品处理 6.5.1拭子样品
人无菌的1.5mL离心管中,编号备用。
6.5.2组织样品 用无菌的剪刀和镊子的取待检样品2.0g于研体或组织匀浆器中布分研后:再加10.0mLPBS(含 牛血清白蛋白、青霉素和链霉)混匀,300r/min离心5min后,取1.0mL上清液转人无菌1.5ml 灭菌离心管中,编号备用。
6.6样品存放 采集或处理好的样品在C&C条件王保存球不超过24h:若需长期保存,应放置一70C冰箱, 但应避免反复冻融冻融不超过3次上 7操作方法 7.1样品核酸提取 7.1.1在样本制备区进行,采取工Hlzol裂解法提联;也可采用其他等效的RNA提取方法。
7.1.2待检样品、用性对照和期性对照的份数总和用表示,取n个火菌1.5ml离心管,适管编号。
7.1.3每管加600LTRol 7.1.4每管对应编号步别加大200gL待检样品、阳性对照或阴性对照,混匀。
7.1.5每管加人0L氧仿,充分顺倒混匀.于4C、12000r/min离心15m. 7.1.6新取n个灭南的1.5mL离心管,逐管编号,每管加人500L异丙醇-20及预冷)。
7.1.7吸取本标准7.1.各管中的上清液500uL,转移至7.1.6相应舶管中,免吸出中间层,颠倒 混匀, 7.1.8于4C、12000r/min离心15min,轻轻倒去上滑,倒置于吸水上,洒干液体,不同样品应在吸 水纸不同地方沥干。
7.1.9每管加入600μL75%乙醇(一20C预冷).顺倒洗涤。
7.1.10于4C、12000r/min离心10min,轻轻倒去上清,例置于吸水纸上,沥干液体,不同样品应在 吸水纸不同地方浙干。
7.1.114000r/min离心10s,将管壁上的残余液体甩到管底部,用微量移液器尽量将其吸干.注意一 份样本换用一个吸头,吸头不要碰到有沉淀一面。
7.1.12室温干燥3min,不宜过于干燥,以免RNA不溶。
7.1.13每管加人11gLDEPC水,轻轻混匀,溶解管壁上的RNA.2000r/min离心5s,获得RNA溶 液,冰浴保存备用(4C保存不超过8h,若需长期保存应放置-70C冰箱)。
7.2扩增试剂的准备与配制 7.2.1在反应混合物配制区进行。
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