中华人民共和国国家标准
代替农业部1485号公告-18-2010
Foodsafety detection of genetically modified organisms and derivedproducts-Bioinformatic analysisfor the allergenicity of proteins
中华人民共和国农业农村部 发布
前言
本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
生物信息学分析方法》.本文件与农业部1485号公告-18一2010相比,除编辑性改动外,主要技术变化 本文件代替农业部1485号公告-18-2010转基因生物及其产品食用安全检测外源蛋白质过敏性
a)更改了名称(见标准题目).
请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由中华人民共和国农业农村部提出.
本文件由全国农业转基因生物安全管理标准化技术委员会归口.
本文件起草单位:中国农业大学、农业农村部科技发展中心、广州医科大学.
本文件主要起草人:贺晓云、黄昆仑、陈红、陶爱林、陈子言、马丽艳、车会莲、黄于艺、胡英新、康琪、何颖.
转基因生物及其产品食用安全检测 蛋白质致敏性生物信息学分析
1范围
本文件规定了利用生物信息学方法对蛋白质进行致敏性分析的方法. 本文件适用于利用生物信息学方法对转基因生物及其产品中的新蛋白质进行致敏性分析.
2术语和定义
2.1
新蛋白质novelprotein
用基因工程手段转人生物体内的外源基因所表达的蛋白质,或经遗传操作后氨基酸序列发生变化的蛋白质,或含量发生显著改变的蛋白质.
2. 2
致敏性allergenicity
外来物质(如花粉、粉尘螨、霉菌、部分食物等)诱发机体免疫系统产生过敏反应的性质.
2.3
致敏性生物信息学分析bioinformatics analysis of allergenicity
白质是否具有潜在的致敏性.
2. 4
E值Evalue
生物信息学比对软件(常用BLASTFASTA)的计算值,反映待测蛋白质与比对序列的相似程度:相似程度越高,E值越小.
3原理
对,判断该蛋白质是否具有潜在的致敏性.如果小于80个氨基酸的待测蛋白质与已知过敏原序列全长比 利用生物信息学方法将待测蛋白质的氨基酸序列与过敏原数据库中的已知过敏原进行序列相似性比对的E值≤0.01,或者大于或等于80个氨基酸的待测蛋白质的80个氨基酸序列滑动窗口与已知过敏原序列存在35%以上的一致性,或者待测蛋白质与已知过敏原序列存在8个连续相同的氨基酸,则该待测蛋白质具有潜在致敏的可能性较高.
4评价数据库
4.1评价数据库选择的依据:优先采用国际公认的权威过敏原数据库:也可以通过对公共数据库中的蛋白质数据进行处理,获得专门的过敏原数据库.
4.2数据库:过敏原数据库(Allergenia,网址 Database,网址 htps:// paredatabase org/),在线过敏原数据库(The Al-lergenOnline Database 网址 http: // allergenonline org/)等.
注:以上数据库为参考数据库,以最新版本为准;如网址有变动以最新网址为准.
5评价方法与指标
5.1全长比对