ICS 07.080 G 04 中华人民共和国国家标准 GB/T30989-2014 高通量基因测序技术规程 Technicalregulation of high-throughputgene sequencing 2014-07-24发布 2015-03-01实施 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布 中国国家标准化管理委员会
GB/T30989-2014 前言 本标准按照GB/T1.1--2009给出的规则起草。
本标准由深圳华因康基因科技有限公司提出。
本标准由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)归口。
本标准起草单位:深圳华因康基因科技有限公司、深圳华因康高通量生物技术研究院、天津康昕瑞 基因科技有限公司、国家人类基因组南方研究中心、中国科学院北京生物物理研究所、深圳市标准技术 研究院、上海交通大学医学院附属瑞金医院。
本标准主要起草人:盛司潼、谭辉彪、金虹、赵国屏、王升跃、陈润生、周文、张俊。
GB/T 30989-2014 高通量基因测序技术规程 1范围 本标准规定了高通量基因测序技术的术语与定义,测序的原理、技术指标、相关主要仪器、测序试剂 及配制和测序方法的要求。
本标准适用于对动物组织、血液、粪便、口腔黏膜、毛发、植物组织、土壤、微生物等生物样品进行高 通量基因测序。
本标准适用于单向测序、双向测序、混合样品测序三种类型的测序,也适用于表达谱测序、ChIP测 序、癌症研究和分型、miRNA测序、微生物元基因组、病菌种类的检测、免疫学和免疫疾病工作、甲基化 测序、序列多态性检测、临床基因诊断、个性化测序和基因组测序。
2规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文 件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法 GB/T27025一2008检测和校准实验室能力的通用要求 JB/T6777紫外可见分光光度计 YY/T0087电泳装置 YY0569Ⅱ级生物安全柜 YY/T0657医用离心机 YY91037电热恒温水浴锅 ASTME1342一1997用冷冻、冷冻干燥和低温养护法保存细菌、真菌、原生生物、病毒、遗传要素 and Low Temperature Maintenance of Bacteria,Fungi,Protista,Viruses, Genetic Elements,and An- imal and Plant Tissues) 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。
3.1 基因gene 位于染色体上编码一个特定功能产物(如蛋白质或RNA分子)的一段核苷酸序列,是遗传信息的 基本单位。
3.2 基因组genome 一种生物体具有的遗传信息的总和。
3.3 核苷酸nucleotide 构成核酸的基本单位,由三部分组成:五碳糖、磷酸和环状的含氮碱基。
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GB/T 30989-2014 3.4 寡核苷酸oligonucleotide 一类短链核苷酸的总称,常用作探针确定DNA或RNA的序列。
3.5 文库library 通过生物来源的、人工合成的或克隆技术等所得到的一个重建分子群,如基因组文库、互补DNA 文库、噬菌体展示肽文库等。
3.6 标签文库tag library 将DNA样品随机打断后,在其两端连接带特定序列的接头,在接头之间的序列称为标签,不 同的标签的集合即为标签文库。
3.7 基因文库genelibrary 整套由基因组DNA片段插人克隆载体获得的分子克隆的总和。
3.8 cDNA文库cDNA library 将处于特定发育阶段真核生物体的特定器官或组织中提取的总RNA,经过反转录等一系列的生化 反应合成双链cDNA群体后,再插人到适当的载体上,经转化寄主菌株构成的特定cDNA克隆群体。
3.9 DNA聚合酶DNApolymerase 以一条DNA链作为模板合成一条新的DNA链时所需要的酶。
3.10 DNA连接酶DNAligase 在DNA复制、修复和重组过程中,由发挥作用的催化磷酸二酯键合成的酶。
3.11 引物primer 在DNA复制过程中,结合于模板链上并作为复制延伸的起始位点和/或终止位点的,具有一定长 度和顺序的寡核苷酸链。
3.12 探针probe 能识别特定碱基序列的、经过人工标记的一小段单链核酸分子,即一段与被测定的核苷酸序列(靶 序列)互补的带标记的单链核苷酸。
3.13 荧光探针fluorescent probe 能识别特定碱基序列的、经过人工标记的一小段单链核酸分子,与待测靶序列互补结合后能发出所 标记荧...