NY
中华人民共和国农业行业标准
Identification of tomato(SolanumLycopersicum L.)varietiesSSRmarkermethod
中华人民共和国农业农村部 了发布
目 次
前言1范围2规范性引用文件 3术语和定义4缩略语原理.6 溶液配制 主要仪器设备及试剂7 8 引物相关信息参照品种10 操作程序12结果判定 11结果统计.附录A(规范性) 主要仪器设备及试剂附录B(规范性) 溶液配制附录C(规范性) 引物名单及序列附录D(资料性) 附录E(资料性) 参照品种相关信息 引物相关信息 10Z
前言
本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由农业农村部种业管理司提出.
本文件由全国植物新品种测试标准化技术委员会(SAC/TC277)归口.
本文件起草单位:农业农村部科技发展中心、北京通州国际种业科技有限公司、北京市农林科学院蔬菜研究所.
本文件主要起草人:韩瑞玺、王均帅、马莹雪、靳风、张建、邓超、王晨宇、霍秀爱、温常龙、冯艳芳、李媛媛、王铭堂、李常保、唐浩、陈红、张秀杰.
番茄品种鉴定SSR分子标记法
1范围
本文件规定了利用简单重复序列(SSR)标记进行番茄(SolanumLycopersicam L.)品种鉴定的操作程序、结果统计与结果判定.
本文件适用于番茄品种SSR指纹数据采集、数据库构建和品种鉴定.
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用面构成本文件必不可少的条款,其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
GB/T3543.2农作物种子检验规程扦样GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法NY/T2594植物品种鉴定DNA分子标记法总则
3术语和定义
NY/T2594规定的术语和定义适用于本文件.
4缩略语
下列缩略语适用于本文件.APS:过硫酸铵(ammonium persulphate)bp:碱基对(base pair) CTAB:十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrimethylammonium bromide)DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid)dNTPs:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxyribonucleoside triphosphate)EDTA;乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetie acid) PAGE:聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis)PCR:聚合酶链式反应(polymerase chain reaction)SSR:简单重复序列(simple sequence repeat)Taq 酶:耐热DNA聚合酶(Taq-DNA polymerase)Tris:三羟甲基氨基甲烷(Tris(hydroxymethyl)methyl aminomethane THAM) TE:三羟甲基氨基甲烷-乙二胺四乙酸(Tris-EDTA)TBE:三羟甲基氨基甲烷-硼酸盐-乙二胺四乙酸(Tris-borate-EDTA)TEMED:四甲基乙二胺(N N N' N'-tetramethylethylenediamine)
5原理
不同番茄品种基因组中SSR的重复次数存在差异,这种差异可通过PCR扩增及电泳方法进行检测,进面区分不同的番茄品种.
6主要仪器设备及试剂
主要仪器设备及试剂见附录A.