NY
中华人民共和国农业行业标准
NY/T4459-2025
水稻品种及其实质性派生品种鉴定 MNP标记法
Identification ofrice varieties and their essentially derivedvarietiesMNPmarkermethod
中华人民共和国农业农村部 了发布
目
前言1范围.3术语和定义 2规范性引用文件4原理5 试剂和材料6仪器设备 7操作程序8质量控制9数据分析10结果判定附录A（规范性） 附录B（资料性） 品种鉴定流程示例 MNP标记和标记检测引物
前言
本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由农业农村部种业管理司提出.
本文件由全国植物新品种测试标准化技术委员会（SAC/TC277）归口.
本文件起草单位：江汉大学、农业农村部科技发展中心、武汉明了生物技术有限公司、湖北省农业科学院、湖南杂交水稻研究中心、崖州湾分子检测鉴定中心、深圳华大智造科技股份有限公司、深圳市真迈生物科技有限公司.
本文件主要起草人：彭海、韩瑞玺、方治伟、周俊飞、荆若男、李甜甜、李论、高利芬、陈利红、万人静、张静、游艾青、刘凯、徐华山、李莉、许娜、宋书锋、包晓东、余进文、颜钦.
水稻品种及其实质性派生品种鉴定 MNP标记法
1范围
za sativaL.）品种鉴定及其实质性派生品种鉴定的术语和定义、原理、主要仪器设备及试剂、引物相关信 本文件规定了利用多核甘酸多态性（MultipleNucleotidePolymorphism，MNP）标记进行水稻（Ory-息、操作程序、数据分析、结果判定与表述.
本文件适用于水稻品种鉴定及其实质性派生品种的鉴定.
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用面构成本文件必不可少的条款，其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适用于本文件.
GB/T3543.2农作物种子检测规程扦样GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB/T38551-2020植物品种鉴定MNP标记法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件.
3. 1
多核苷酸多态性multiple nucleotide polymorphism，MNP
在一段核昔酸序列中，由一个或多个核昔酸变异引起的序列多态性.
[来源：GB/T38551.3.1，有修改]
3. 2
实质性派生品种essentially derivedvariety，EDV
别，并且除派生引起的性状差异外在表达由原始品种基因型或者基因型组合产生的基本性状方面与原始 由原始品种实质性派生，或者由该原始品种的实质性派生品种派生出来的品种，与原始品种有明显区品种相同.
[来源：《中华人民共和国种子法》，第九十条第十款]
平均覆盖倍数average coverage
在基因组上比对到标记位点上的测序片段的总数与标记位点总数的比值.
[来源：GB/T38551-2020 3.4，有修改]
3. 4
检出标记位点detectedmarkers
至少有一个等位基因型且有20条及以上测序片段支持的标记位点.
[来源：GB/T38551-2020，3.5，有修改]
4原理
水稻品种及其实质性派生品种的基因组中存在着能够世代稳定遗传的MNP位点.利用多重聚合酶链式反应（PCR）、二代高通量测序以及生物信息学方法扩增、检测和分析品种MNP标记，获得MNP标记
