中华人民共和国国家标准
GB/T28063-2011
Detection and identification of bean pod mottle virus
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草.
本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口
本标准起草单位:中华人民共和国厦门出人境检验检疫局、中华人民共和国福建出入境检验检疫局、中华人民共和国深圳出入境检验检疫局.
本标准主要起草人:廖富荣、沈建国、郑耘、陈青、林石明、陈红运、黄蓬英、吴媛.
菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法
1范围
本标准规定了藥豆荚斑驳病毒血清学和分子生物学的检测鉴定方法.
本标准适用于可能携带该病毒的豆科作物的种子、苗木等植物繁殖材料的检测鉴定,也适用于传播该病毒介体昆虫的检测鉴定.
2菜豆英斑驳病毒基本信息
中文名:菜豆荚斑驳病毒.
英文名:bean pod mottle virus.
异名:bean podmottle ovirus(菜豆荚斑驳病毒),pod mottle virus(荚斑驳病毒),desmodiumvirus(金钱草病毒).
英文缩写:BPMV.
属虹豆花叶病毒科Comoviridae、虹豆花叶病毒属Comovirx.
菜豆夹斑驳病毒的其他信息参见附录A.
3方法原理
利用基于抗原抗体反应的双抗夹心酶联免疫吸附测定(DAS-ELISA)、反转录和体外DNA扩增技术的反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)进行检测鉴定.
4主要仪器设备
本标准的检测鉴定方法主要使用以下仅器设备:
槽、凝胶成像仪、高速冷冻台式离心机、水浴槽、pH计和各种量程的可调移液器(1000ul、200pL、 微量榨汁机、酶标仪、洗板机、微量天平(感量:0.001g)、PCR仪、荧光PCR仪、电泳仪、水平电泳100 μl 20 μ1 2 μL).
5检测样品的制备
5.1DAS-ELISA和IC-RT-PCR检测样品的制备
对每批送检样品进行症状检查,优先选取具有褐色或黑色斑驳症状的种子(从种脐开始),或者选取具有斑驳、皱缩、褪绿等症状的叶片.
样品提取缓冲液继续研磨. 种子样品:称取0.5g~1.0g的种皮作为检测样品,在液氮中充分研磨,回温后按1:10比例加人
叶片样品:称取0.5g~1.0g的叶片作为检测样品,在研体中研磨或在液氮中研磨,按1:10比例加人样品提取缓冲液继续研磨.
录B)和IC-RT-PCR(见附录C)检测提取液. 把研磨后的样品转移到5mL离心管中,8000r/min离心5min,上清液作为DAS-ELISA(见附
注:提取液在3h内使用,否期保存在4C中.
5.2RT-PCR检测样品的制备
称取表现症状的0.1g叶片、种子等样品在液氮中充分研磨后,利用TRIzol方法提取RNA,(见附录D 中的 D.3)
6检测与鉴定
6.1检测鉴定流程
通常,初筛时采用 DAS-ELISA 检测方法.当DAS-ELISA产生阳性结果时,再采用IC-RT-PCR或RT-PCR等方法进行验证.
当首先采用IC-RT-PCR或RT-PCR方法检测时,如果产生阳性结果,则通过实时荧光RT-PCR方法或序列测定等方法验证.
6.2DAS-ELISA 检测
把制备的样品上清液加入已包被BPMV抗体的在96微孔板中,进行DAS-ELISA检测,每个样品取缓冲液作空白对照,其中阴性对照种类和材料(如:种子或叶片)应该尽量与所检测样品相一致. 平行加到两个孔中.用健康的植物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对照,用样品提
具体操作过程见附录B.
6.3RT-PCR检测
对照用感染BPMV的植物组织作阳性对照用超纯水作空白对照. 分别提取样品和对照的总RNA,反转录合成cDNA后,进行PCR扩增,用健康的植物组织作阴性
具体操作过程见附录D.
6.4IC-RT-PCR 检测
把制备的样品上清液加入已包被BPMV抗体的离心管中然后进行RT-PCR扩增.用健康的植物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对照,用超纯水作空白对照.
具体操作过程见附录C.
6.5序列测定
将PCR产物回收后,进行克隆、测序,或者直接测序,测序可由生物公司完成.把测序所得到的核昔酸序列翻译成氨基酸后与已知的BPMV相应序列进行比对,如果与已知的BPMV相应序列同源性 大于75%则判定为BPMV序列,同源性小于75%则判定为非BPMV序列.
注:序列比对可利用 NCBI 网站上的 BLAST 款件进行,网址为 hrtp:// ncbi nlm. nih gov/BLAST/
7结果判定与报告
7.1结果判定
当DAS-ELISA检测、IC-RT-PCR(或RT-PCR)检测、其中两种方法的检测结果呈阳性时,则判定为检出BPMV;
当IC-RT-PCR或RT-PCR检测结果呈阳性,测定的序列为BPMV序列时,则判定为检出BPMV.
7.2结果记录与保存
记录各项实验数据,包括样品种类、来源,检测时间、地点、方法和结果等.DAS-ELISA检测结果保存吸光值的数据报告,IC-RT-PCR或RT-PCR检测结果保存电泳照片,序列测定结果保存测序报告图.