中华人民共和国国家标准
GB/T31801-2015
丁香疫霉菌检疫鉴定方法
Detection and identification of Phytophthora syringaeKleb.
中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布
前言
本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草.请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任. 本标准由全国植物检疫标准化技术委员会(SAC/TC271)提出并归口本标准起草单位:中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国天津出入境检验检疫局.本标准主要起草人:杜洪忠、罗加风、吴品珊、严进.
丁香疫霉菌检疫鉴定方法
1范围
本标准规定了丁香疫霉菌的检疫鉴定方法.
本标准适用于针对丁香疫霉菌寄主的苗本、枝条、枝叶、果实及其夹带土壤和介质中丁香疫霉菌的鉴定,
2位器和用具
2.1仪器
生物显微镜,超净工作台,光照培养箱,电子天平(1/1000g),高压灭菌锅,冰箱,PCR扩增仪,荧光PCR扩增仪,电泳仪,凝胶成像仪,高速冷冻离心机,恒温水浴锅.
2.2用具
烧杯,三角瓶,量筒,试管,培养Ⅲ,酒精灯,镊子,剪刀,解剖刀,接种针,载玻片,盖玻片,塑料研,移液器,移液器吸头,离心管,液氮罐.
3试剂、材料和培养基
3.1试剂
β-谷留醇,匹马霉素(pimaricin),氨苄青霉素钠盐(ampicillin),利福平钠盐(rifampicin),五氯硝基苯(pentachloronitrobenzene),恶霉灵(hymexazol),CaCO ,琼脂糖,Tris-HCl MgCl,HCl,乙二胺四乙酸四钠盐(EDTA),NaOH,NaOAc,KCI,Tris,十六烷基三甲基溴化铵(CTAB),TAE,无水乙醇(ethanol),三氯甲烷(chloroform),异丙醇(isopropanol),异戊醇(isoamyl alcohol),SYBR Green I核酸染料,Man-MGB 探针 PS-Pr. 蛋白酶K,TaqDNA聚合酶,dNTP,通用引物ITS5和1TS4,实时荧光PCR引物PS-F和PS-R及Taq-
3.2材料
琼脂粉,V8汁,夏栎叶片或苹果或梨,鲜橙皮或杜鹃叶片.
3.3培养基
PDA培养基,V8培养基,V8鲜橙皮培养基,V8杜鹃叶片培养基,选择性培养基PARPH-V8.具体配方参见附录A.
4检疫鉴定方法
4.1症状检查
检查寄主植物的根、茎、叶、果实等部位,对有枯萎、果腐、根腐、颈腐和流胶症状的植物,以及根周围
GB/T 31801-2015
的土壤和介质取样送实验室做进一步检验.丁香疫霉菌为害症状参见附录A.
4.2寄主组织分离培养
可疑症状的根、茎、叶、果实用流水冲洗表面约15min,取根、茎、叶、果实果皮的病健交界处,剪成5mm×5mm小块,75%乙醇消毒30s,无菌水冲洗3次,吸干水分,置选择性培养基PARPH-V8上,17℃黑暗培养.
培养4d~6d后,组织周围培养基上长出稀疏菌落,挑取菌落边缘菌丝块转人V8培养基或PDA培养基纯化,17C黑暗培养.
4.3土壤和介质诱集
称量土块或介质25g,碾碎放人500mL.灭菌洁净烧杯中.无菌水将土样或介质润湿(无流动水),保鲜膜覆盖封口.置于17℃~20C黑暗条件下放置3d~5d
(Quercas robur)叶片或未成熟的萃果或梨果实的小切片,切片大小以漂浮在水面为宜,Parafilm膜封口 每份样品加灭菌蒸馏水,水面距土表4.0cm然后加人10片左右直径8mm~10mm的新鲜夏栎保湿,17℃~20℃黑暗条件下放置.
4.4诱集检查和培养
诱集2d~3d后,观察夏标叶片或苹果或裂附近是否有棕色病变区,从变色的病健交界处取5mm×5mm小块,75%乙醇消毒30s,置V8培养基或选择性培养基PARPH-V8,17C黑暗培养.
培养4d~6d后,组织周围培养基上长出稀疏菌落,挑取菌落边缘菌丝块转人V8培养基纯化或PDA培养基,17C黑暗培养.
4.5孢子囊和菌丝膨大体诱发
取纯化后菌落边缘菌丝块,置于盛有10mL无菌水的培养Ⅲ中.17C~20C黑暗条件下诱发孢子囊和菌丝膨大体,48h后观察菌丝块周围孢子囊和菌丝膨大体产生情况.
4.6卵孢子诱发
取纯化后菌落边缘菌丝块,置于加人β-谷留醇(20mg/L)或植物油(玉米油、亚麻籽油、麦芽油)的V8培养基中,黑暗条件下8℃~10C低温培养4周.
如果寄主材料是柑橘属的果实,则将纯化后菌落边缘菌丝块置于V8鲜橙皮培养基或V8杜鹃叶片培养基,10C黑暗培养,7d后观测病菌卵孢子产生情况.
4.7DNA提取
收集分离到的病菌菌丝,采用CTAB法提取核酸.参见附录B.
4.8实时荧光PCR检测
实时荧光PCR引物序列为PS-F:5'-GTCTGGCTTCGGCTGGAT-3‘和PS-R:5'-AGTGGGC-TACTAGCTCCAGGC-3′.TaqMan-MGB 探针 PS-Pr: 5′-(FAM) TGGCGACCGCTCTGA (NFQMGB)-3,探针5'端标记的荧光报告基团为FAM.3'端标记的非荧光猝灭基团为MGB.
dNTPs 2 pl 10 μmol/L Primers 各 1 yL10 μmol/L 探针 PH-Pr 1.5 μL5 U/μL Tag DNA 聚合酶 反应体系(25pL):样品DNA 1L,10×PCR缓冲液2.5pl,25mmol/LMgCl2μL,2.5mmol/L0.3 μL ddH; O 13.7 μL
反应循环为94℃10min;94℃15s,56℃60s.循环40次.
4.9ITS基因检测和序列比对分析
可以选择利用真菌通用引物PCR扩增后测序比对的分子方法.
利用真菌通用引物 ITS5(5'-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3')和ITS4(5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’)进行扩增.
反应体系(25pL);样品 DNA 1 pl 10× PCR 缓冲液 2.5 yL 25 mmol/L MgCl; 2 pL 2.5 mmol/LdNTPs 2 pL 10 pmol/L Primers 各 1 μzL5 U/μL Taq DNA 聚合酶 0.3 μL ddH;O 15.2 μL.同时设置空白对照,以Tris-EDTA缓冲液代答DNA 样品.
PCR反应条件为:94℃C 4min:95C 1 min,56℃30s 72℃C 45 s35个循环;72℃10min;4C保存.
PCR产物的检测,在1×TAE电泳缓冲液中,1.5%琼脂糖(含SYBRGreen1核酸染料)凝胶电泳,5V/cm,凝胶成像仪分析结果.如有900bp左右大小的条带出现,将扩增产物进行序列测定.
BLAST分析. 将测序后的序列与NCBI 网站 GenBank中公开发表的 Phytophikora syringae 的序列进行
5签定特征
5.1生物学特征
5.1.1菌落特征
状或菊花花瓣状,菌落的花瓣区域较尖、窄,菌落形态图参见附录C.在PDA上菌落边缘约呈花瓣状, 丁香疫霉菌在V8培养基和PDA培养基上生长较为缓慢.在V8培养基上菌落稀疏,呈放射状、星乳白色,菌丝体浓密菌落中央区域皱孔状.
5.1.2病菌形态
倒梨形,不易脱落,单独生在顶端或整个集结在一个孢子囊梗上.孢子囊大小为(21.0μm~75.0gm)× 无性生殖阶段孢子囊梗呈单歧聚伞花序状分枝.孢子囊具有不完全的乳头状突起,形状为卵形或(11.0μm~42.0μm),平均47.0μm×30.0μm,长宽比在1.1:1至2.111之间,孢子囊不易脱落,不增殖,但可直接在附近萌发产生一个新的孢子囊.孢子囊具有平的盖,裂开释放游动孢子,游动孢子卵形,侧生二根鞭毛.
内含物最终会逐渐释放殆尽,成为空壳. 病菌易产生菌丝膨大体,念珠状,卵形、球形或不规则形,常萌发产生较细的菌丝,菌丝膨大体中的
病菌为同宗配合,藏卵器球形,直径23.4μm~40.0μm:卵孢子充满藏卵器,通常为圆形,黄色,大小为20.1μm~34.7xcm;雄器单个或数个,平滑,多侧生.
丁香疫霉菌的形态图参见附录C.
5.1.3与近似种的形态区别
与丁香疫霉菌在形态上较为近似的是冬生疫霉菌(Phytophzhora hibernalis),主要区别为丁香疫霉菌落的花瓣区域较尖、窄,孢子囊不易脱落,具有菌丝膨大体,雄器多侧生;冬生疫霉菌落的花瓣区域较宽,孢子囊易脱落,无菌丝膨大体,维器多围生,参见附录D.
5.2实时荧光PCR检测
若阴性对照及空白对照的Ct值40,供试菌Ct值≤36,可判定为阳性.