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GB/T 32132-2015 动物性材料(羊毛、羊绒、鸭绒、鹅绒)属性DNA鉴定方法 实时荧光PCR法.pdf

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中华人民共和国国家标准

GB/T 32132-2015

动物性材料(羊毛、羊绒、鸭绒、鹅绒)属 性DNA鉴定方法实时荧光PCR法

DNA identification ofwool.cashmere.duck's down.goose's down animalmaterials-Real-time fluorescence PCRmethod

中国国家标准化管理委员会 中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局 发布

前言

本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草.本标准由全国生化检测标准化技术委员会(SAC/TC387)提出并归口. 本标准起草单位:深圳市计量质量检测研究院、中国测试技术研究院、珠海出人境检验检疫局.本标准主要起草人:陈国培、赣心田、林霖、周李华、梁玉英、莫秋华、洪晓明、唐复润、胡科新、何永盛、杨友红、杨志敏、杨国武、杨泽.

动物性材料(羊毛、羊绒、鸭绒、鹅绒)属 性DNA鉴定方法实时荧光PCR法

1范围

本标准规定了羊毛、羊绒、鸭绒、鹅绒动物性材料中DNA成分实时荧光PCR定性检验方法.本标准适用于动物性材料中羊毛、羊绒、鸭绒、鹅绒等动物源性DNA成分的鉴定.

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的一凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件.凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.

GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法

3原理

本标准使用十二烷基磺酸钠-异硫氰酸脏-3-硫基乙醇法或其他等效DNA提取法,获得适用于实时荧光PCR反应,检测其中是否含有各种动物源性DNA成分,从而达到对动物性材料进行属性DNA成 荧光PCR检测的DNA,同时依据多种动物的物种特异性基因片段设计成特异性荧光引物,通过实时分定性检测的目的.

4仪器设备及器具

4.1实时荧光PCR仪.4.2超净工作台.4.3离心机(最高转数15000g).0~04.5恒温水浴锅:(65土1)℃. 4.6超纯水系统(电阻率>18.2MΩcm).4.7紫外分光光度计:230nm260nm 280nm.

5试剂和材料

5.12% SDS 溶液:称取2gSDS(sodium dodecyl sulfate,sodium salt,十二烷基磺酸钠)粉末,加人5 mL 1 mol/L Tris-HC1(pH8.o)[Tris: tris (hydroxymethy1) aminomethane,三(羟甲基)氨基甲烷]及4 mL0.5 mol/LEDTA(pH8.0)(ethylene diaminetetraacetic acid,乙二胺四乙酸),加水定容至100mL,室温保存.

5.2异硫氰酸眠提取液:称取47.25g异硫氰酸胍、1.75g氯化钠、4gPVPK-40(PolyvinylpyrrolidoneK-40,聚乙烯略烷酮K-40),加人5mL1mol/LTris-HC1(pH8.0)及4mL0.5mol/LEDTA

(pH8.0),加水定容至100mL,室温保存.5.31mol/LTris-HC1(pH8.0):800mL水中溶解121.1gTris碱,盐酸调pH值至8.0 加水至1000mL,高压灭菌,室湿保存.5.40.5mol/LEDTA(pH8.0):800mL水中溶解186.1g乙二胺四乙酸二钠盐,NaOH调pH值至 8.0,补水至1000mL,高压灭菌,室温保存.5.53mol/L乙酸钠溶液:称取408.1g三水乙酸钠,加人800mL水溶解,用冰乙酸调节pH值至5.2,加水定容至1000mL,高压灭菌,4C保存.5.6酚:氯仿:异戊醇:25:24:1(体积比). 5.7担体:非同一物种的植物或非脊椎动物基因组DNA,推荐使用糖原.5.8无水乙醇、异丙醇、3-疏基乙醇等有机试剂.5.9PremixExTag(2X),也可用等效的其他Taq酶或Tag 酶预混液.5.10引物和探针:动物性材料中羊毛、羊绒、鸭绒、鹅绒等动物源性DNA成分实时荧光PCR检测所用的荧光引物序列见表1.

表1实时荧光PCR检测所用荧光引物序列

检测基因 引物序列 探针序列脊椎动物 5′-AGATAGAAACCGACCTGGATT-3*内参照基因 5′-TTTACGACCTCGATGTTGGAT-3* 5′-FAM-TCCGGTCTGAACTCAGATCACGTA-BHQ-3′羊毛内源基因 5′-ACTTOCAATCAGTGAAATTGAC -3′ 5′-FAM- TGGAGCTTTAACTAAGTAACTCAAGGA -BHQ-3*羊绒内源基国 5′-TTCTOOGAGGTCACCCCAA-3′ 5′-FAM-TGGAGCTTTAACTAACTAGTCCAAAAG -BHQ-3′鸭绒内源基国 5′ACGTACATACCGCUCGTCA-3* 5 ′-FAM-ACATAATTAATACCACGTAAATGCCAA -BHQ-3? 5′-FAM-ACATAACTAATACCCTAAACATGCCAA -BHQ-3′绒内源基国 5′-ATTCTAAGTACACCTTCCGGT -3′ 5′-FAM-ATAACTAATACCATAAATACGCTGAA-BHQ-3?

6操作步骤

6.1模板DNA的提取

于样品不同部位取样,取0.05g~0.1g剪碎样品,加入3mL2% SDS溶液,65℃水浴1.5h,不时振荡;12000g离心5min,弃去上清液;加入3mL异硫氰酸胍提取液及60uLβ-蕴基乙醇,65C水浴4.5h,不时振荡;12000g离心5min,吸取上清液;加人等体积酚:氯仿:异戊醇(2524:1),颠倒混匀;12 000g离心10min;吸取上清液,加人3μL20mg/mL糖原.1/10体积的3mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)及等体积异丙醇,一20C沉淀过夜,12000g离心15min收集沉淀;小心倒去上清,用70%乙 醇洗涤二次,风干:加人50gL灭菌去离子水溶解沉淀.

6.1.2模板DNA提取的其他办法

可用等效DNA提取试剂盒提取模板DNA.

6.1.3样品DNA质量评估

取10gLDNA溶液加蒸馏水稀释至1mL,用紫外分光光度计分别测定260nm和280nm的吸光

值,DNA的浓度按照式(1)计算,当OD/OD比值在1.5~2.0之间时,符合PCR检测要求.扩增前将样品 DNA 调至约 10 ng/pL~100 ng/pl.

式中:

c--DNA浓度,单位为纳克每微升(ng/uL);

A260nm 处的吸光值;

N核酸稀释倍数.

6.2试样的PCR反应

6.2.1阳性对照和空白对照的设置

6.2.1.1阳性对照

以含所检源性成分的动物性材料及其加工产品的DNA为模板.

6.2.1.2阴性对照

以不含所检源性成分的动物性材料及其加工产品的DNA为模板.

6.2.1.3空白对照

设置两个,一是提取DNA时设置的提取空白对照(以水代替样品),二是PCR反应的空白对照(以水代替DNA模板).

6.2.2实时荧光PCR反应体系

实时荧光PCR反应体系见表2,每个样品各做两个平行管.加样时应使样品DNA溶液完全落人反应液中,不要粘附于管壁上,加样后应尽快盖紧管盖.

表2实时荧光PCR反应体系

试剂名称 体积Premix Ex Taq(2×) 10 μl.10 μmol/L. 引物(上游) 0.4 pl.10μmol/1. 引物(下游) 0.4 yl.10 ytaol/1 探针 0.2 μL.DNA模板 10 ng~100 ng补水至 20 μl.注:表中DNA模板的加样量,可视所提取DNA的浓度适当增减模板量.

6.2.3实时荧光PCR反应参数

实时荧光PCR反应参数为:预变性95℃30s 95℃58.60℃34s 40个循环.注:不同仅器可根据仪器要求将反应参数作适当调整.

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