中华人民共和国国家标准
农业农村部公告第1012号-20-2026
Molecular characterization of transgenic plants-Part 2:Datarequirements for genome sequencing
中华人民共和国农业农村部发布
前言
本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
本文件是（转基因植物分子特征》的第2部分.《转基因植物分子特征》已经发布了以下部分：
第1部分：数据资料；
-一第2部分：基因组测序数据要求.
请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.
本文件由中华人民共和国农业农村部提出.
本文件由全国农业转基因生物安全管理标准化技术委员会归口.
转基因植物分子特征 第2部分：基因组测序数据要求
1范围
料、方法、测序深度、数据质量、序列分析方法、测序数据、测序分析结论. 本文件规定了利用基因组测序解析转基因、基因编辑植物等分子特征，在安全评价申报时应提交的材
本文件适用于转基因、基因编辑植物等安全评价申报时，提交采用基因组测序方法获得的分子特征数据.
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用面构成本文件必不可少的条款.其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适用于本文件，
GB/T40664-2021用于高通量测序的核酸类样本质量控制通用要求
量评估
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件.
3.1
测序深度depth of sequencing
待测样本中某个指定的核苷酸或某条指定的序列被检测的次数.
3.2
测序覆盖率coverage rate of sequencing
总长度）. 待测样本的核苷酸序列检测结果覆盖于参考序列上的比例（测序覆盖率=覆盖区域长度÷参考序列
3.3
读序reads
高通量测序平台产生的含有碱基序列和质量值的一段序列.
从测序仅上获得的原始的、未经过处理的测序数据.
去除原始数据中低质量碱基和接头序列的数据.
同时含有外源插人片段和受体基因组的一段DNA序列，即具有转化体特异性的一段DNA序列.
在基因组水平上单个核苷酸碱基序列的变化，包括单个核苷酸的替代、插入或缺失.
