T/YALAS 020-2025 实验动物 羊驼微卫星 DNA 遗传学检测方法.pdf

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T /YALAS 云南省实验动物学会团体标准

T/YALAS020-2025

物 实验动物羊驼微卫星DNA遗传学检测方法

Laboratory animal-Detection method ofmicrosatelliteDNAdetection ofgeneticdiversity for Alpacas

云南省实验动物学会 发布

目次

前1范围,2规范性引用文件3术语和定义 3.1实验羊驼3.2微卫星4检测方法.4.1采样4.3基因组DNA 提取 4.2微卫星DNA位点4.4PCR反应体系及扩增条件4.5PCR扩增产物检测4.6基因分型 45数据统计分析与结果判定, V

前言

本文件按照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.

请注意本文件的某些内容可能涉及专利.本文件的发布机构不承担识别专利的责任.

本文件由云南省实验动物学会提出.

本文件由云南省实验动物学会(YALAS)归口.

本文件起草单位:中国科学院昆明动物研究所、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所、云南省实验动物学会.

物 、张伟、 王野、肖文娴、夏长友、陈洪岩、

实验动物羊驼微卫星DNA遗传学检测方法

1范围

本文件规定了实验羊驼微卫星DNA遗传学检测方法、数据统计分析与结果判定.

本文件适用于实验羊驼遗传质量控制及遗传组成分析等.

2规范性引用文件

仅该日期对应的版本适用于本文不注目期的开用文件/其最新版本(包括的修改单)适用于本文件. 物

NY/T541兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范

NY/T1673畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件.

3.1实验羊驼laboratoryalpaca

经人工培育,对其携带的病原微生物和寄生虫实行控制,遗传背景明确或者来源清楚,用于科学研究、教学、生产、检定及其他科学实验的羊驼.

3.2微卫星DNA microsatellite DNA

也称短串联重复序列或简单重复序列,指生物体基因组中由16个核苷酸组成的串联重复序列.

4检测方法

4.1采样

实验羊驼外观检查应无异常,核对编号:采集静脉血0.5mL,-20C低温保存,采样方法应按照NY/T541进行.

4.2微卫星DNA位点

羊驼微卫星DNA位点的名称、引物序列、等位基因数、PCR反应的退火温度应符合表1规定.

表1羊驼微卫星DNA位点

序号 名称 等位基因(n) 引物序列(5-3') 参考范围(bp) 等位基因 退火温度LCA56 16 ATGGTGTTTACAGGGCGTTG 133-169 (C)1 GCATTACTGAAAAGCCCAGG 58LCA63 14 TTACCCAGTCCTTCGTGGG 190-254 562 GGAACCTCGTGGTTATGGAA3 LCA65 14 AACTCAGCTGTTGTCAGGGG TTTTTCCCCTGTGGTTGAAT 165-191 58GTGCAGCGTCCAAATAGTCA4 LCA66 24 CCAGCATCGTCCAGTATTCA 220-262 565 LCA68 10 TCCTGTCTGTGAGAAGGCTG 191-209 56CCGAAGGAAAAATAAAATGGAA TTCTGATGTATGGCATAGCGA6 LCA70 TGGGGGTAAGAGCAGGATAA 211-223 567 LCA71 CAGACATATACCTGTATCCGTATCTA 1-91 566 TTCAGTGTTTCCTCGCAATG8 LCA77 S1 TGTTGACTAGAGCCTTTTCTTCTTT GGGCAAGAGAGACTGACTGG 233-263 58YWLL02 GTGCACTCAGATACCTTCACA 278-290 569 TACATCTGEAATGATCGAOCC10 L0TAA CACATGCCTGTTCCCTCTGAT 150-152 58GACAAACCACAAGCATAAACC ATCAAGTTTGAGGTGCTTTCC11 YWLL08 3 CCATGGCATTGTGTTGAAGAC 135-177 6012 607AA 9 IOAAGTCTAGGAACCGGAATGC AGTCAATCTACACTCCTIGC 154-180 60CTCACAGACCACAGFFCCAGT13 YWLL19 6 AAGGTCCATCCATGTTGTCAC 137-161 6014 YWLL29 6 GAAGGCAGGAGAAAAGGTAG 218-232 56CAGAGGCTTAATAACTTGCAG15 YWLL30 3 AAGCAGGATAGTGGTGGAAGT TTAAGGGTTCCCTGTATTTGG 104-110 58AGTCTTGGTGTGGTGGTAGAA16 YWLL 36 7 TGCCAGGATACTGACAGTGAT 148-166 5617 YWLL38 3 GGCCTAAATCCTACTAGAC 841421 60CACATGACCATGTCCCCTTAT CCTCTCACTCTTGTTCTCCTC18 YWLL40 6 CCAGTGACAGTGTGACTAAGA 180-190 5819 YWLL43 10 ATACCTCTCTTGCTCTCTCTC 131-157 58

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