T/HNSBSXH
海南省博士协会团体标准
T/HNSBSXH 022025
农业本体网络构建技术规范
Technical specification for the construction of agricultural ontology network
海南省博士协会发布
目录
目录.前 言1范围.2规范性引用文件,3术语和定义4构建原则.5农业本体数据要求.5.1农业本体数据类别 5.2农业本体数据格式5.3农业本体数据关系, h6农业本体数据推理, h6.1基础关系推理6.2分级相关性关系推理,7农业本体网络管理及可视化 7.1农业本体网络系统.7.2农业本体自动化导入7.3农业本体自动化推理,7.4农业本体网络可视化, 7.5农业本体网络管理,参考文献
前言
本文件按照《团体标准结构和编写指南》T/CAS1.1-2017要求并参照GB/T1.1-2020《标准化工作导则第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草.
本文件由中国农业科学院农业信息研究所、三亚中国农业科学院国家南繁研究院提出.
本文件由海南省博士协会归口.
本文件主要起草人:周国民、张建华、樊景超、闫秦、陈晓静、贺子康、赵晓燕、王健、王晓丽、刘婷婷、满芮、王溢飞.
农业本体网络构建技术规范
1范围
本文件适用于农业本体网络的构建、管理及分析.
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用面构成本文件必不可少的条款.其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件:不注日期的引用文件,其最新版本(包括的修改单)适用于本文件.
ISO/IEC21838-1:2021《信息技术-顶层本体(TL0)-第1部分:要求》
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件.
3. 1
农业本体agriculturalontology
学科领域中一套得到认同的、关于概念体系的明确、正式的规范说明.”]
3.2
农业本体关系agriculturalontologyrelations
3.3
农业本体网络agriculturalontologynetwork
是通过在农业及相关领域多套本体中,构建术语间的新关系,联结多张术语关系图形成的整体性术语网络,旨在加强术语间的关联与语义表达,支撑农业领域的知识融合与应用.
[来源:Ontology Infrastructure White Paper Version 2.0.0 2019/07,有修改]
3. 4
农业本体推理ontologicalreasoning
依据农业本体的语义和逻辑,对实体类型及实体之间的关系进行推理. [来源:《基于0m描述的本体推理研究》文献,有修改]
3.5
农业本体网络系统agriculturalontologynetworksystem
是指基于农业本体数据构建的知识管理与应用系统,对农业领域的本体知识和数据进行语义化建模与关联,形成高效的知识表示和推理体系.该系统以农业本体为核心,通过描述领域概念、属性及其相互关系,实现农业信息的标准化表达和语义互操作.
[来源:Ontology Infrastructure White Paper Version 2.0.0 2019/07,有修改]
4构建原则
一致性:本体内部的概念和关系应该保持逻辑上的一致性.
准确性:确保本体中的概念和关系准确反映农业科学的实际状况.
可扩展性:设计时应考虑到未来可能新增的概念或关系,使得本体能够灵活地适应变化.
互操作性:确保本体能够与其他系统或本体有效交互.
5农业本体数据要求
5.1农业本体数据类别
农业本体数据包括但不限于以下3类,具体见表1.生物信息类:包括基因、蛋白质、细胞等与生物研究信息相关的农业本体. 农业实体类:包括环境,食品,农业活动等与农业实体相关的本体.农业性状表型类:包括农业表型或性状等相关的农业本体.
表1农业本体数据类别
英文名称 中文名称 本体格式 类别OBO Metadlata OntologySequcnce Ontology OBO元数据本体(OMO) OBOGene Ontology 序列本体(SO) OBO基因本体(GO) OBOProtein Ontology ChEBI Ontology 生化实体本体(CHEBI) OBO蛋白质本体(PRO) OBOCell Ontology 细胞本体(CL) OBO 生物信息类Anatomical Entity Ontology 解制实体本体(AEO) OBOEMBRACE Data and EMBRACE 数据和方法本 OBOMethods Ontology 体(EDAM)Relation Ontology 关系本体 (RO) OBOBioinformatics Web Services 生物信息学Web服务本体 OWLontology (OBIWS)Plant Ontology 植物本体(PO) OBOEnvironment Ontology 环境本体(ENVO) OBOPlant Experimental 植物实验条件本体(PECO) OBOConditions OntologyAgronomy Ontology 农学本体(AGRO) OWL 农业实体类Small-scale fisheries & 小规模渔业和水产养殖本体 OWLaquaculture ontology (SSFAO)Plant Trait ontology 特质本体(TO) OBOFood Ontology 食品本体(FOODON) OWLCompositional Dietary 组合膳食 OBO